Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ARAP1-213ENST00000536993 315 ntTSL 210.11□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 CEMIP-206ENST00000560027 648 ntTSL 29.73□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ALDOC-204ENST00000435638 579 ntTSL 39.62□□□□□ -0.873e-20■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PNPO-204ENST00000583245 518 ntTSL 59.53□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PNPO-205ENST00000583599 696 ntTSL 49□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PNPO-209ENST00000641285 488 nt9□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 TGFB1-203ENST00000598758 559 ntTSL 58.7□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 33.2
RPS3P23396 SPTAN1-234ENST00000637032 152 ntTSL 58.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PNPO-213ENST00000641511 453 nt7.61□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 ACSL5-209ENST00000496328 667 ntTSL 36.89□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 33.2
RPS3P23396 PIH1D1-222ENST00000601825 381 ntTSL 316.02■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 PIH1D1-206ENST00000595516 841 ntTSL 315.78■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 PIH1D1-213ENST00000597415 874 ntTSL 515.6■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 PIH1D1-217ENST00000599366 833 ntTSL 315.44■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 PIH1D1-207ENST00000595550 583 ntTSL 214.98□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 PIH1D1-203ENST00000593900 932 ntTSL 214.03□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 PIH1D1-205ENST00000595074 1037 ntTSL 213.56□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 NDUFS3-202ENST00000524568 733 ntTSL 218.77■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 33.1
RPS3P23396 CPD-203ENST00000579502 672 ntTSL 56.48□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 33.1
RPS3P23396 CLTC-211ENST00000579815 609 ntTSL 56.2□□□□□ -1.423e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 GHDC-206ENST00000586692 542 ntTSL 416.92■□□□□ 0.34e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 GHDC-208ENST00000588352 559 ntTSL 516.72■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 GHDC-204ENST00000585375 592 ntTSL 215.47■□□□□ 0.074e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 GHDC-210ENST00000590249 561 ntTSL 415.12■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 GHDC-211ENST00000590520 585 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-8■■■■■ 33.1
RPS3P23396 CCL20-204ENST00000489160 673 ntTSL 32.73□□□□□ -1.974e-14■■■■■ 33
RPS3P23396 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.025e-12■■■■■ 33
RPS3P23396 PDE3A-202ENST00000542675 685 ntTSL 311.13□□□□□ -0.635e-12■■■■■ 33
RPS3P23396 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 33
RPS3P23396 MRPL27-206ENST00000511860 869 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 33
RPS3P23396 MRPL27-205ENST00000508200 636 ntTSL 310.66□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 33
RPS3P23396 MRPL27-204ENST00000507088 732 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 33
RPS3P23396 MRPL27-202ENST00000442592 2441 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 33
RPS3P23396 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 33
RPS3P23396 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 33
RPS3P23396 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 33
RPS3P23396 HYOU1-203ENST00000527038 629 ntTSL 222.11■■□□□ 1.138e-12■■■■■ 33
RPS3P23396 HYOU1-211ENST00000532421 582 ntTSL 218.84■□□□□ 0.618e-12■■■■■ 33
RPS3P23396 HYOU1-205ENST00000529174 549 ntTSL 416.9■□□□□ 0.38e-12■■■■■ 33
RPS3P23396 HYOU1-222ENST00000622474 549 ntTSL 215.7■□□□□ 0.18e-12■■■■■ 33
RPS3P23396 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 33
RPS3P23396 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 33
RPS3P23396 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.725e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 EML2-228ENST00000592482 666 ntTSL 215.44■□□□□ 0.065e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 FUBP3-205ENST00000487406 840 ntTSL 513.49□□□□□ -0.255e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 RFXANK-208ENST00000540977 389 ntTSL 211.07□□□□□ -0.645e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 LMNA-209ENST00000459904 916 ntTSL 214.26□□□□□ -0.133e-11■■■■■ 32.9
RPS3P23396 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 MAP1LC3B-206ENST00000564844 3085 ntTSL 1 (best)19.56■□□□□ 0.728e-13■■■■■ 32.9
RPS3P23396 MAP1LC3B-208ENST00000570189 1259 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.248e-13■■■■■ 32.9
RPS3P23396 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.038e-13■■■■■ 32.9
RPS3P23396 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.193e-53■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SDHD-209ENST00000640554 727 ntTSL 513.93□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 32.9
RPS3P23396 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 32.9
RPS3P23396 DMAC1-202ENST00000469050 458 ntTSL 310.84□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 32.9
RPS3P23396 DMAC1-203ENST00000484082 547 ntTSL 54.24□□□□□ -1.733e-7■■■■■ 32.9
RPS3P23396 EMC7-204ENST00000532113 607 ntTSL 521.62■■□□□ 1.052e-10■■■■■ 32.9
RPS3P23396 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.892e-10■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 32.9
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RPS3P23396 WDR6-214ENST00000488572 610 ntTSL 418.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.375e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 EMC7-202ENST00000527822 581 ntTSL 217.28■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-216ENST00000489684 1155 ntTSL 215.96■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 415.07■□□□□ 02e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-213ENST00000553038 2045 ntTSL 1 (best)13.87□□□□□ -0.195e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-205ENST00000476143 581 ntTSL 313.37□□□□□ -0.275e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-211ENST00000471162 3565 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.445e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-204ENST00000420783 3656 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-221ENST00000610967 4259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 PHB-211ENST00000511933 852 ntTSL 211.36□□□□□ -0.592e-24■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-204ENST00000465705 760 ntTSL 511.07□□□□□ -0.643e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 YIPF5-202ENST00000448443 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-207ENST00000448293 3377 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 WDR6-208ENST00000452875 3916 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 YIPF5-204ENST00000513112 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.675e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-209ENST00000628579 477 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 PIN4-204ENST00000423432 1605 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-206ENST00000481278 752 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 NDUFB3-201ENST00000237889 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC8.36□□□□□ -1.075e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 PIN4-201ENST00000218432 1780 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 32.9
RPS3P23396 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 32.9
RPS3P23396 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 32.9
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