Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF6Q99612 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF6Q99612 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms