RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557119.2

PITX2-209, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PITX2, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-209ENST00000557119 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.07■■■■■ 5.29
PITX2-209ENST00000557119 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.34■■■■■ 4.21
PITX2-209ENST00000557119 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
PITX2-209ENST00000557119 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.92■■■■□ 3.98
PITX2-209ENST00000557119 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.83■■■■□ 3.97
PITX2-209ENST00000557119 ABCC9O60706 1549 aa39.54■■■■□ 3.92
PITX2-209ENST00000557119 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.17■■■■□ 3.86
PITX2-209ENST00000557119 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
PITX2-209ENST00000557119 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.92■■■■□ 3.82
PITX2-209ENST00000557119 NACADO15069 1562 aa38.25■■■■□ 3.71
PITX2-209ENST00000557119 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.13■■■■□ 3.69
PITX2-209ENST00000557119 SCRIBQ14160 1630 aa38.11■■■■□ 3.69
PITX2-209ENST00000557119 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.07■■■■□ 3.68
PITX2-209ENST00000557119 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.64
PITX2-209ENST00000557119 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.36■■■■□ 3.57
PITX2-209ENST00000557119 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.23■■■■□ 3.55
PITX2-209ENST00000557119 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.16■■■■□ 3.54
PITX2-209ENST00000557119 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.53
PITX2-209ENST00000557119 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.51
PITX2-209ENST00000557119 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.94■■■■□ 3.5
PITX2-209ENST00000557119 WIZO95785 1651 aa36.91■■■■□ 3.5
PITX2-209ENST00000557119 SMARCA4P51532 1647 aa36.68■■■■□ 3.46
PITX2-209ENST00000557119 TRIM41Q8WV44 630 aa36.68■■■■□ 3.46
PITX2-209ENST00000557119 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.65■■■■□ 3.46
PITX2-209ENST00000557119 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
PITX2-209ENST00000557119 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
PITX2-209ENST00000557119 SMARCA2P51531 1590 aa36.28■■■■□ 3.4
PITX2-209ENST00000557119 HRCP23327 699 aa36.27■■■■□ 3.4
PITX2-209ENST00000557119 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.25■■■■□ 3.39
PITX2-209ENST00000557119 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.24■■■■□ 3.39
PITX2-209ENST00000557119 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.24■■■■□ 3.39
PITX2-209ENST00000557119 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PITX2-209ENST00000557119 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
PITX2-209ENST00000557119 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.88■■■■□ 3.33
PITX2-209ENST00000557119 ABCC8Q09428 1581 aa35.8■■■■□ 3.32
PITX2-209ENST00000557119 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.8■■■■□ 3.32
PITX2-209ENST00000557119 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.72■■■■□ 3.31
PITX2-209ENST00000557119 EEA1Q15075 1411 aa35.68■■■■□ 3.3
PITX2-209ENST00000557119 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PITX2-209ENST00000557119 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.27
PITX2-209ENST00000557119 SOGA1O94964 1423 aa35.42■■■■□ 3.26
PITX2-209ENST00000557119 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.35■■■■□ 3.25
PITX2-209ENST00000557119 HMGXB3Q12766 1538 aa35.35■■■■□ 3.25
PITX2-209ENST00000557119 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.33■■■■□ 3.25
PITX2-209ENST00000557119 NCAPD3P42695 1498 aa35.32■■■■□ 3.24
PITX2-209ENST00000557119 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.31■■■■□ 3.24
PITX2-209ENST00000557119 SYNJ1O43426 1573 aa35.27■■■■□ 3.24
PITX2-209ENST00000557119 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
PITX2-209ENST00000557119 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.21■■■■□ 3.23
PITX2-209ENST00000557119 CEP162Q5TB80 1403 aa35.19■■■■□ 3.22
PITX2-209ENST00000557119 GOLGA3Q08378 1498 aa35.18■■■■□ 3.22
PITX2-209ENST00000557119 KIF21BO75037 1637 aa35.12■■■■□ 3.21
PITX2-209ENST00000557119 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
PITX2-209ENST00000557119 TOP2BQ02880 1626 aa35.07■■■■□ 3.21
PITX2-209ENST00000557119 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.07■■■■□ 3.2
PITX2-209ENST00000557119 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.02■■■■□ 3.2
PITX2-209ENST00000557119 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
PITX2-209ENST00000557119 CFTRP13569 1480 aa34.86■■■■□ 3.17
PITX2-209ENST00000557119 PRDM2Q13029 1718 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX2-209ENST00000557119 CUX1P39880 1505 aa34.67■■■■□ 3.14
PITX2-209ENST00000557119 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.67■■■■□ 3.14
PITX2-209ENST00000557119 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.64■■■■□ 3.14
PITX2-209ENST00000557119 CLIP1P30622 1438 aa34.64■■■■□ 3.14
PITX2-209ENST00000557119 PRXQ9BXM0 1461 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX2-209ENST00000557119 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.55■■■■□ 3.12
PITX2-209ENST00000557119 KIF27Q86VH2 1401 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX2-209ENST00000557119 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.47■■■■□ 3.11
PITX2-209ENST00000557119 NESP48681 1621 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX2-209ENST00000557119 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
PITX2-209ENST00000557119 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
PITX2-209ENST00000557119 APLP2Q06481 763 aa34.18■■■■□ 3.06
PITX2-209ENST00000557119 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.17■■■■□ 3.06
PITX2-209ENST00000557119 ARAP1Q96P48 1450 aa34.16■■■■□ 3.06
PITX2-209ENST00000557119 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PITX2-209ENST00000557119 IGF1RP08069 1367 aa34.09■■■■□ 3.05
PITX2-209ENST00000557119 CUX2O14529 1486 aa34.09■■■■□ 3.05
PITX2-209ENST00000557119 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.08■■■■□ 3.05
PITX2-209ENST00000557119 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.06■■■■□ 3.04
PITX2-209ENST00000557119 ERCC6Q03468 1493 aa34■■■■□ 3.03
PITX2-209ENST00000557119 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.99■■■■□ 3.03
PITX2-209ENST00000557119 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.96■■■■□ 3.03
PITX2-209ENST00000557119 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.95■■■■□ 3.03
PITX2-209ENST00000557119 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.95■■■■□ 3.02
PITX2-209ENST00000557119 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.92■■■■□ 3.02
PITX2-209ENST00000557119 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.87■■■■□ 3.01
PITX2-209ENST00000557119 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
PITX2-209ENST00000557119 TOPBP1Q92547 1522 aa33.84■■■■□ 3.01
PITX2-209ENST00000557119 MAP3K1Q13233 1512 aa33.82■■■■□ 3
PITX2-209ENST00000557119 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
PITX2-209ENST00000557119 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
PITX2-209ENST00000557119 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
PITX2-209ENST00000557119 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
PITX2-209ENST00000557119 CUL7Q14999 1698 aa33.69■■■□□ 2.98
PITX2-209ENST00000557119 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
PITX2-209ENST00000557119 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.65■■■□□ 2.98
PITX2-209ENST00000557119 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.64■■■□□ 2.98
PITX2-209ENST00000557119 WDR97A6NE52 1622 aa33.62■■■□□ 2.97
PITX2-209ENST00000557119 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
PITX2-209ENST00000557119 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.59■■■□□ 2.97
PITX2-209ENST00000557119 TIAM1Q13009 1591 aa33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms