Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL18AQ02543 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL18AQ02543 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RPL18AQ02543 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPL18AQ02543 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL18AQ02543 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL18AQ02543 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RPL18AQ02543 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RPL18AQ02543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPL18AQ02543 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPL18AQ02543 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPL18AQ02543 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms