RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.7■■■■■ 5.39
KCNS1-202ENST00000537075 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.56■■■■■ 4.4
KCNS1-202ENST00000537075 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
KCNS1-202ENST00000537075 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.6■■■■■ 4.09
KCNS1-202ENST00000537075 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.28■■■■■ 4.04
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC9O60706 1549 aa40.23■■■■■ 4.03
KCNS1-202ENST00000537075 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.22■■■■■ 4.03
KCNS1-202ENST00000537075 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.83■■■■□ 3.97
KCNS1-202ENST00000537075 NACADO15069 1562 aa39.62■■■■□ 3.93
KCNS1-202ENST00000537075 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
KCNS1-202ENST00000537075 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.3■■■■□ 3.88
KCNS1-202ENST00000537075 SCRIBQ14160 1630 aa39.09■■■■□ 3.85
KCNS1-202ENST00000537075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.59■■■■□ 3.77
KCNS1-202ENST00000537075 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.46■■■■□ 3.75
KCNS1-202ENST00000537075 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.11■■■■□ 3.69
KCNS1-202ENST00000537075 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
KCNS1-202ENST00000537075 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.66
KCNS1-202ENST00000537075 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.83■■■■□ 3.65
KCNS1-202ENST00000537075 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
KCNS1-202ENST00000537075 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.62■■■■□ 3.61
KCNS1-202ENST00000537075 SMARCA4P51532 1647 aa37.48■■■■□ 3.59
KCNS1-202ENST00000537075 WIZO95785 1651 aa37.4■■■■□ 3.58
KCNS1-202ENST00000537075 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.15■■■■□ 3.54
KCNS1-202ENST00000537075 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.02■■■■□ 3.52
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM41Q8WV44 630 aa36.99■■■■□ 3.51
KCNS1-202ENST00000537075 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
KCNS1-202ENST00000537075 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
KCNS1-202ENST00000537075 SMARCA2P51531 1590 aa36.85■■■■□ 3.49
KCNS1-202ENST00000537075 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.84■■■■□ 3.49
KCNS1-202ENST00000537075 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.65■■■■□ 3.46
KCNS1-202ENST00000537075 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
KCNS1-202ENST00000537075 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.6■■■■□ 3.45
KCNS1-202ENST00000537075 NCAPD3P42695 1498 aa36.54■■■■□ 3.44
KCNS1-202ENST00000537075 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
KCNS1-202ENST00000537075 HMGXB3Q12766 1538 aa36.5■■■■□ 3.43
KCNS1-202ENST00000537075 HRCP23327 699 aa36.5■■■■□ 3.43
KCNS1-202ENST00000537075 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.45■■■■□ 3.43
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC8Q09428 1581 aa36.33■■■■□ 3.41
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
KCNS1-202ENST00000537075 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.08■■■■□ 3.37
KCNS1-202ENST00000537075 SOGA1O94964 1423 aa35.85■■■■□ 3.33
KCNS1-202ENST00000537075 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.78■■■■□ 3.32
KCNS1-202ENST00000537075 EEA1Q15075 1411 aa35.75■■■■□ 3.31
KCNS1-202ENST00000537075 SYNJ1O43426 1573 aa35.71■■■■□ 3.31
KCNS1-202ENST00000537075 CFTRP13569 1480 aa35.71■■■■□ 3.31
KCNS1-202ENST00000537075 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.71■■■■□ 3.31
KCNS1-202ENST00000537075 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
KCNS1-202ENST00000537075 PRDM2Q13029 1718 aa35.65■■■■□ 3.3
KCNS1-202ENST00000537075 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.59■■■■□ 3.29
KCNS1-202ENST00000537075 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.56■■■■□ 3.28
KCNS1-202ENST00000537075 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.53■■■■□ 3.28
KCNS1-202ENST00000537075 CEP162Q5TB80 1403 aa35.52■■■■□ 3.28
KCNS1-202ENST00000537075 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.5■■■■□ 3.27
KCNS1-202ENST00000537075 GOLGA3Q08378 1498 aa35.42■■■■□ 3.26
KCNS1-202ENST00000537075 TOP2BQ02880 1626 aa35.36■■■■□ 3.25
KCNS1-202ENST00000537075 KIF21BO75037 1637 aa35.35■■■■□ 3.25
KCNS1-202ENST00000537075 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.35■■■■□ 3.25
KCNS1-202ENST00000537075 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.31■■■■□ 3.24
KCNS1-202ENST00000537075 NESP48681 1621 aa35.31■■■■□ 3.24
KCNS1-202ENST00000537075 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.28■■■■□ 3.24
KCNS1-202ENST00000537075 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
KCNS1-202ENST00000537075 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
KCNS1-202ENST00000537075 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.21■■■■□ 3.23
KCNS1-202ENST00000537075 CUX1P39880 1505 aa35.18■■■■□ 3.22
KCNS1-202ENST00000537075 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.05■■■■□ 3.2
KCNS1-202ENST00000537075 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.04■■■■□ 3.2
KCNS1-202ENST00000537075 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.95■■■■□ 3.19
KCNS1-202ENST00000537075 CLIP1P30622 1438 aa34.93■■■■□ 3.18
KCNS1-202ENST00000537075 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.91■■■■□ 3.18
KCNS1-202ENST00000537075 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.86■■■■□ 3.17
KCNS1-202ENST00000537075 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
KCNS1-202ENST00000537075 PRXQ9BXM0 1461 aa34.84■■■■□ 3.17
KCNS1-202ENST00000537075 TOPBP1Q92547 1522 aa34.83■■■■□ 3.17
KCNS1-202ENST00000537075 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.81■■■■□ 3.16
KCNS1-202ENST00000537075 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.79■■■■□ 3.16
KCNS1-202ENST00000537075 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
KCNS1-202ENST00000537075 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
KCNS1-202ENST00000537075 KIF27Q86VH2 1401 aa34.71■■■■□ 3.15
KCNS1-202ENST00000537075 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
KCNS1-202ENST00000537075 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
KCNS1-202ENST00000537075 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.6■■■■□ 3.13
KCNS1-202ENST00000537075 CUX2O14529 1486 aa34.56■■■■□ 3.12
KCNS1-202ENST00000537075 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.53■■■■□ 3.12
KCNS1-202ENST00000537075 ARAP1Q96P48 1450 aa34.52■■■■□ 3.12
KCNS1-202ENST00000537075 ERCC6Q03468 1493 aa34.51■■■■□ 3.12
KCNS1-202ENST00000537075 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.5■■■■□ 3.11
KCNS1-202ENST00000537075 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
KCNS1-202ENST00000537075 WDR97A6NE52 1622 aa34.45■■■■□ 3.1
KCNS1-202ENST00000537075 WDR62O43379 1518 aa34.43■■■■□ 3.1
KCNS1-202ENST00000537075 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
KCNS1-202ENST00000537075 IGF1RP08069 1367 aa34.36■■■■□ 3.09
KCNS1-202ENST00000537075 APLP2Q06481 763 aa34.35■■■■□ 3.09
KCNS1-202ENST00000537075 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.28■■■■□ 3.08
KCNS1-202ENST00000537075 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.25■■■■□ 3.07
KCNS1-202ENST00000537075 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
KCNS1-202ENST00000537075 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
KCNS1-202ENST00000537075 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.17■■■■□ 3.06
KCNS1-202ENST00000537075 IFT140Q96RY7 1462 aa34.17■■■■□ 3.06
KCNS1-202ENST00000537075 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.16■■■■□ 3.06
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