Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC004494.1-201ENST00000613210 2775 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHACTR3-201ENST00000355648 2247 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A11-208ENST00000565769 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TLE4-201ENST00000265284 2382 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms