Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
KRTAP21-1Q3LI58 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP21-1Q3LI58 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
KRTAP21-1Q3LI58 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
KRTAP21-1Q3LI58 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KRTAP21-1Q3LI58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KRTAP21-1Q3LI58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP21-1Q3LI58 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
KRTAP21-1Q3LI58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-1Q3LI58 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
KRTAP21-1Q3LI58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
KRTAP21-1Q3LI58 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-1Q3LI58 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
KRTAP21-1Q3LI58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
KRTAP21-1Q3LI58 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms