RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf170-201ENST00000623052 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.05■□□□□ 0.96
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C9orf170-201ENST00000623052 CEP162Q5TB80 1403 aa20.89■□□□□ 0.93
C9orf170-201ENST00000623052 SYNJ1O43426 1573 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf170-201ENST00000623052 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf170-201ENST00000623052 EEA1Q15075 1411 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf170-201ENST00000623052 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.83■□□□□ 0.92
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C9orf170-201ENST00000623052 PRDM2Q13029 1718 aa20.24■□□□□ 0.83
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C9orf170-201ENST00000623052 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
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C9orf170-201ENST00000623052 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.81■□□□□ 0.76
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C9orf170-201ENST00000623052 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.8■□□□□ 0.76
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C9orf170-201ENST00000623052 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.77■□□□□ 0.76
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.77■□□□□ 0.75
C9orf170-201ENST00000623052 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
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C9orf170-201ENST00000623052 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.73■□□□□ 0.75
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