RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.75■■■□□ 2.51
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PTDSS1-202ENST00000517309 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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PTDSS1-202ENST00000517309 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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PTDSS1-202ENST00000517309 ITGAEP38570 1179 aa25.57■■□□□ 1.68
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PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.75■■□□□ 1.55
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PTDSS1-202ENST00000517309 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.45■■□□□ 1.5
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PTDSS1-202ENST00000517309 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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PTDSS1-202ENST00000517309 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
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