Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP2LQ5T4T6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2LQ5T4T6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms