RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287912.7

RBM33-201, Transcript of RNA binding motif protein 33, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RBM33, Length 1,404 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM33-201ENST00000287912 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.84■■■■■ 6.69
RBM33-201ENST00000287912 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.41■■■■■ 5.66
RBM33-201ENST00000287912 ABCC9O60706 1549 aa49.01■■■■■ 5.44
RBM33-201ENST00000287912 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
RBM33-201ENST00000287912 NACADO15069 1562 aa47.31■■■■■ 5.16
RBM33-201ENST00000287912 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.28■■■■■ 5.16
RBM33-201ENST00000287912 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.24■■■■■ 5.15
RBM33-201ENST00000287912 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.15■■■■■ 5.14
RBM33-201ENST00000287912 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.06■■■■■ 5.12
RBM33-201ENST00000287912 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.23■■■■■ 4.99
RBM33-201ENST00000287912 SCRIBQ14160 1630 aa46■■■■■ 4.95
RBM33-201ENST00000287912 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.89■■■■■ 4.94
RBM33-201ENST00000287912 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.82■■■■■ 4.93
RBM33-201ENST00000287912 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
RBM33-201ENST00000287912 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.72■■■■■ 4.75
RBM33-201ENST00000287912 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.74
RBM33-201ENST00000287912 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.36■■■■■ 4.69
RBM33-201ENST00000287912 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.24■■■■■ 4.67
RBM33-201ENST00000287912 SMARCA4P51532 1647 aa44.05■■■■■ 4.64
RBM33-201ENST00000287912 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
RBM33-201ENST00000287912 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.81■■■■■ 4.6
RBM33-201ENST00000287912 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.73■■■■■ 4.59
RBM33-201ENST00000287912 SMARCA2P51531 1590 aa43.68■■■■■ 4.58
RBM33-201ENST00000287912 NCAPD3P42695 1498 aa43.66■■■■■ 4.58
RBM33-201ENST00000287912 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.63■■■■■ 4.58
RBM33-201ENST00000287912 HMGXB3Q12766 1538 aa43.49■■■■■ 4.55
RBM33-201ENST00000287912 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
RBM33-201ENST00000287912 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
RBM33-201ENST00000287912 WIZO95785 1651 aa43.34■■■■■ 4.53
RBM33-201ENST00000287912 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
RBM33-201ENST00000287912 NESP48681 1621 aa42.51■■■■■ 4.4
RBM33-201ENST00000287912 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
RBM33-201ENST00000287912 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.45■■■■■ 4.39
RBM33-201ENST00000287912 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.39■■■■■ 4.38
RBM33-201ENST00000287912 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.38■■■■■ 4.37
RBM33-201ENST00000287912 CFTRP13569 1480 aa42.22■■■■■ 4.35
RBM33-201ENST00000287912 ERCC6Q03468 1493 aa42.2■■■■■ 4.35
RBM33-201ENST00000287912 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.13■■■■■ 4.34
RBM33-201ENST00000287912 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.03■■■■■ 4.32
RBM33-201ENST00000287912 PRDM2Q13029 1718 aa41.91■■■■■ 4.3
RBM33-201ENST00000287912 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.9■■■■■ 4.3
RBM33-201ENST00000287912 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
RBM33-201ENST00000287912 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.83■■■■■ 4.29
RBM33-201ENST00000287912 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.71■■■■■ 4.27
RBM33-201ENST00000287912 CUX2O14529 1486 aa41.68■■■■■ 4.26
RBM33-201ENST00000287912 WDR62O43379 1518 aa41.58■■■■■ 4.25
RBM33-201ENST00000287912 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
RBM33-201ENST00000287912 TOPBP1Q92547 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
RBM33-201ENST00000287912 ABCC8Q09428 1581 aa41.26■■■■■ 4.2
RBM33-201ENST00000287912 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.26■■■■■ 4.2
RBM33-201ENST00000287912 CUX1P39880 1505 aa41.1■■■■■ 4.17
RBM33-201ENST00000287912 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
RBM33-201ENST00000287912 IFT140Q96RY7 1462 aa40.93■■■■■ 4.14
RBM33-201ENST00000287912 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
RBM33-201ENST00000287912 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.89■■■■■ 4.14
RBM33-201ENST00000287912 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
RBM33-201ENST00000287912 SYNJ1O43426 1573 aa40.82■■■■■ 4.13
RBM33-201ENST00000287912 TOP2BQ02880 1626 aa40.81■■■■■ 4.12
RBM33-201ENST00000287912 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.81■■■■■ 4.12
RBM33-201ENST00000287912 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.76■■■■■ 4.12
RBM33-201ENST00000287912 SOGA1O94964 1423 aa40.75■■■■■ 4.11
RBM33-201ENST00000287912 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
RBM33-201ENST00000287912 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
RBM33-201ENST00000287912 WDR97A6NE52 1622 aa40.57■■■■■ 4.09
RBM33-201ENST00000287912 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.085e-8■■■■■ 32.1
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RBM33-201ENST00000287912 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
RBM33-201ENST00000287912 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.35■■■■■ 4.05
RBM33-201ENST00000287912 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.31■■■■■ 4.04
RBM33-201ENST00000287912 GRIN2BQ13224 1484 aa40.26■■■■■ 4.03
RBM33-201ENST00000287912 PBRM1Q86U86 1689 aa40.22■■■■■ 4.03
RBM33-201ENST00000287912 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.17■■■■■ 4.02
RBM33-201ENST00000287912 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.02
RBM33-201ENST00000287912 TRIM41Q8WV44 630 aa40.08■■■■■ 4.01
RBM33-201ENST00000287912 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.04■■■■■ 4
RBM33-201ENST00000287912 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.02■■■■■ 4
RBM33-201ENST00000287912 KIF27Q86VH2 1401 aa40.02■■■■■ 4
RBM33-201ENST00000287912 CHD1O14646 1710 aa40.02■■■■■ 4
RBM33-201ENST00000287912 SYNJ2O15056 1496 aa39.97■■■■□ 3.99
RBM33-201ENST00000287912 OSCARQ8IYS5 282 aa39.95■■■■□ 3.99
RBM33-201ENST00000287912 ADAMTS12P58397 1594 aa39.94■■■■□ 3.98
RBM33-201ENST00000287912 FBLN2P98095 1184 aa39.91■■■■□ 3.98
RBM33-201ENST00000287912 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
RBM33-201ENST00000287912 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.85■■■■□ 3.97
RBM33-201ENST00000287912 IGF1RP08069 1367 aa39.83■■■■□ 3.97
RBM33-201ENST00000287912 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.82■■■■□ 3.97
RBM33-201ENST00000287912 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.77■■■■□ 3.96
RBM33-201ENST00000287912 GRIN2AQ12879 1464 aa39.76■■■■□ 3.96
RBM33-201ENST00000287912 CUL7Q14999 1698 aa39.72■■■■□ 3.95
RBM33-201ENST00000287912 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.62■■■■□ 3.93
RBM33-201ENST00000287912 NUP160Q12769 1436 aa39.59■■■■□ 3.93
RBM33-201ENST00000287912 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.58■■■■□ 3.93
RBM33-201ENST00000287912 CEP170Q5SW79 1584 aa39.56■■■■□ 3.92
RBM33-201ENST00000287912 EEA1Q15075 1411 aa39.44■■■■□ 3.9
RBM33-201ENST00000287912 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.4■■■■□ 3.9
RBM33-201ENST00000287912 ARHGEF11O15085 1522 aa39.37■■■■□ 3.89
RBM33-201ENST00000287912 PRXQ9BXM0 1461 aa39.36■■■■□ 3.89
RBM33-201ENST00000287912 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.33■■■■□ 3.89
RBM33-201ENST00000287912 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.33■■■■□ 3.89
RBM33-201ENST00000287912 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.33■■■■□ 3.89
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