RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.77■■■■■ 5.56
SNX18-201ENST00000326277 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.86■■■■■ 4.45
SNX18-201ENST00000326277 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
SNX18-201ENST00000326277 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.48■■■■■ 4.23
SNX18-201ENST00000326277 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.11■■■■■ 4.17
SNX18-201ENST00000326277 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.01■■■■■ 4.16
SNX18-201ENST00000326277 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
SNX18-201ENST00000326277 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.17■■■■■ 4.02
SNX18-201ENST00000326277 ABCC9O60706 1549 aa40.07■■■■■ 4
SNX18-201ENST00000326277 SCRIBQ14160 1630 aa39.77■■■■□ 3.96
SNX18-201ENST00000326277 NACADO15069 1562 aa39.76■■■■□ 3.96
SNX18-201ENST00000326277 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.25■■■■□ 3.87
SNX18-201ENST00000326277 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
SNX18-201ENST00000326277 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.93■■■■□ 3.82
SNX18-201ENST00000326277 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.74■■■■□ 3.79
SNX18-201ENST00000326277 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.59■■■■□ 3.77
SNX18-201ENST00000326277 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.57■■■■□ 3.77
SNX18-201ENST00000326277 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.32■■■■□ 3.73
SNX18-201ENST00000326277 WIZO95785 1651 aa38.32■■■■□ 3.72
SNX18-201ENST00000326277 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.16■■■■□ 3.7
SNX18-201ENST00000326277 SMARCA4P51532 1647 aa38.08■■■■□ 3.69
SNX18-201ENST00000326277 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.68
SNX18-201ENST00000326277 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
SNX18-201ENST00000326277 TRIM41Q8WV44 630 aa37.72■■■■□ 3.63
SNX18-201ENST00000326277 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.6■■■■□ 3.61
SNX18-201ENST00000326277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
SNX18-201ENST00000326277 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.55■■■■□ 3.6
SNX18-201ENST00000326277 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
SNX18-201ENST00000326277 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.5■■■■□ 3.59
SNX18-201ENST00000326277 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.27■■■■□ 3.56
SNX18-201ENST00000326277 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
SNX18-201ENST00000326277 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
SNX18-201ENST00000326277 ABCC8Q09428 1581 aa37.1■■■■□ 3.53
SNX18-201ENST00000326277 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.78■■■■□ 3.48
SNX18-201ENST00000326277 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.75■■■■□ 3.47
SNX18-201ENST00000326277 NCAPD3P42695 1498 aa36.75■■■■□ 3.47
SNX18-201ENST00000326277 HMGXB3Q12766 1538 aa36.73■■■■□ 3.47
SNX18-201ENST00000326277 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.66■■■■□ 3.46
SNX18-201ENST00000326277 SOGA1O94964 1423 aa36.58■■■■□ 3.45
SNX18-201ENST00000326277 SYNJ1O43426 1573 aa36.52■■■■□ 3.44
SNX18-201ENST00000326277 EEA1Q15075 1411 aa36.46■■■■□ 3.43
SNX18-201ENST00000326277 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.42■■■■□ 3.42
SNX18-201ENST00000326277 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
SNX18-201ENST00000326277 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.33■■■■□ 3.41
SNX18-201ENST00000326277 HRCP23327 699 aa36.28■■■■□ 3.4
SNX18-201ENST00000326277 TOP2BQ02880 1626 aa36.22■■■■□ 3.39
SNX18-201ENST00000326277 CFTRP13569 1480 aa36.2■■■■□ 3.39
SNX18-201ENST00000326277 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.2■■■■□ 3.39
SNX18-201ENST00000326277 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.14■■■■□ 3.38
SNX18-201ENST00000326277 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.13■■■■□ 3.38
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA3Q08378 1498 aa36.09■■■■□ 3.37
SNX18-201ENST00000326277 CEP162Q5TB80 1403 aa36.07■■■■□ 3.36
SNX18-201ENST00000326277 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
SNX18-201ENST00000326277 KIF21BO75037 1637 aa35.99■■■■□ 3.35
SNX18-201ENST00000326277 CUX1P39880 1505 aa35.99■■■■□ 3.35
SNX18-201ENST00000326277 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.98■■■■□ 3.35
SNX18-201ENST00000326277 PRDM2Q13029 1718 aa35.97■■■■□ 3.35
SNX18-201ENST00000326277 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.92■■■■□ 3.34
SNX18-201ENST00000326277 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SNX18-201ENST00000326277 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.77■■■■□ 3.32
SNX18-201ENST00000326277 KIF27Q86VH2 1401 aa35.63■■■■□ 3.29
SNX18-201ENST00000326277 PRXQ9BXM0 1461 aa35.61■■■■□ 3.29
SNX18-201ENST00000326277 CLIP1P30622 1438 aa35.59■■■■□ 3.29
SNX18-201ENST00000326277 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.58■■■■□ 3.29
SNX18-201ENST00000326277 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.55■■■■□ 3.28
SNX18-201ENST00000326277 NESP48681 1621 aa35.46■■■■□ 3.27
SNX18-201ENST00000326277 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.46■■■■□ 3.27
SNX18-201ENST00000326277 CUX2O14529 1486 aa35.41■■■■□ 3.26
SNX18-201ENST00000326277 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
SNX18-201ENST00000326277 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.37■■■■□ 3.25
SNX18-201ENST00000326277 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
SNX18-201ENST00000326277 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.33■■■■□ 3.25
SNX18-201ENST00000326277 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.32■■■■□ 3.24
SNX18-201ENST00000326277 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
SNX18-201ENST00000326277 IGF1RP08069 1367 aa35.28■■■■□ 3.24
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.27■■■■□ 3.24
SNX18-201ENST00000326277 TOPBP1Q92547 1522 aa35.25■■■■□ 3.23
SNX18-201ENST00000326277 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
SNX18-201ENST00000326277 ARAP1Q96P48 1450 aa35.14■■■■□ 3.22
SNX18-201ENST00000326277 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.14■■■■□ 3.22
SNX18-201ENST00000326277 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.11■■■■□ 3.21
SNX18-201ENST00000326277 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.1■■■■□ 3.21
SNX18-201ENST00000326277 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
SNX18-201ENST00000326277 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.07■■■■□ 3.2
SNX18-201ENST00000326277 APLP2Q06481 763 aa35.07■■■■□ 3.2
SNX18-201ENST00000326277 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.98■■■■□ 3.19
SNX18-201ENST00000326277 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.95■■■■□ 3.19
SNX18-201ENST00000326277 WDR97A6NE52 1622 aa34.9■■■■□ 3.18
SNX18-201ENST00000326277 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
SNX18-201ENST00000326277 CUL7Q14999 1698 aa34.81■■■■□ 3.16
SNX18-201ENST00000326277 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.75■■■■□ 3.15
SNX18-201ENST00000326277 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
SNX18-201ENST00000326277 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
SNX18-201ENST00000326277 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.67■■■■□ 3.14
SNX18-201ENST00000326277 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
SNX18-201ENST00000326277 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
SNX18-201ENST00000326277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.59■■■■□ 3.13
SNX18-201ENST00000326277 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.59■■■■□ 3.13
SNX18-201ENST00000326277 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.51■■■■□ 3.11
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