Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYCP2LQ5T4T6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYCP2LQ5T4T6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SYCP2LQ5T4T6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYCP2LQ5T4T6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYCP2LQ5T4T6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYCP2LQ5T4T6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYCP2LQ5T4T6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYCP2LQ5T4T6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYCP2LQ5T4T6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYCP2LQ5T4T6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2LQ5T4T6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SYCP2LQ5T4T6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SYCP2LQ5T4T6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYCP2LQ5T4T6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SYCP2LQ5T4T6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2LQ5T4T6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYCP2LQ5T4T6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYCP2LQ5T4T6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYCP2LQ5T4T6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYCP2LQ5T4T6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYCP2LQ5T4T6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYCP2LQ5T4T6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYCP2LQ5T4T6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYCP2LQ5T4T6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SYCP2LQ5T4T6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYCP2LQ5T4T6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYCP2LQ5T4T6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYCP2LQ5T4T6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SYCP2LQ5T4T6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCP2LQ5T4T6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYCP2LQ5T4T6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCP2LQ5T4T6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2LQ5T4T6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCP2LQ5T4T6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCP2LQ5T4T6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2LQ5T4T6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCP2LQ5T4T6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCP2LQ5T4T6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCP2LQ5T4T6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYCP2LQ5T4T6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCP2LQ5T4T6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2LQ5T4T6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2LQ5T4T6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCP2LQ5T4T6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SYCP2LQ5T4T6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCP2LQ5T4T6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SYCP2LQ5T4T6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SYCP2LQ5T4T6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCP2LQ5T4T6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SYCP2LQ5T4T6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SYCP2LQ5T4T6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SYCP2LQ5T4T6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SYCP2LQ5T4T6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYCP2LQ5T4T6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYCP2LQ5T4T6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYCP2LQ5T4T6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SYCP2LQ5T4T6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYCP2LQ5T4T6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2LQ5T4T6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2LQ5T4T6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYCP2LQ5T4T6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYCP2LQ5T4T6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYCP2LQ5T4T6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2LQ5T4T6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2LQ5T4T6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYCP2LQ5T4T6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2LQ5T4T6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYCP2LQ5T4T6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYCP2LQ5T4T6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYCP2LQ5T4T6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYCP2LQ5T4T6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYCP2LQ5T4T6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYCP2LQ5T4T6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYCP2LQ5T4T6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYCP2LQ5T4T6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYCP2LQ5T4T6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SYCP2LQ5T4T6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2LQ5T4T6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYCP2LQ5T4T6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SYCP2LQ5T4T6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2LQ5T4T6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2LQ5T4T6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP2LQ5T4T6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2LQ5T4T6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYCP2LQ5T4T6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYCP2LQ5T4T6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYCP2LQ5T4T6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms