Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC6Q16204 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC6Q16204 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC6Q16204 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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