RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233535.8

SLC30A3-201, Transcript of solute carrier family 30 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC30A3, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A3-201ENST00000233535 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.5■■■■■ 5.68
SLC30A3-201ENST00000233535 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.31■■■■■ 4.52
SLC30A3-201ENST00000233535 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
SLC30A3-201ENST00000233535 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.39■■■■■ 4.38
SLC30A3-201ENST00000233535 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.95■■■■■ 4.31
SLC30A3-201ENST00000233535 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.5■■■■■ 4.23
SLC30A3-201ENST00000233535 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
SLC30A3-201ENST00000233535 ABCC9O60706 1549 aa40.59■■■■■ 4.09
SLC30A3-201ENST00000233535 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.59■■■■■ 4.09
SLC30A3-201ENST00000233535 SCRIBQ14160 1630 aa40.37■■■■■ 4.05
SLC30A3-201ENST00000233535 NACADO15069 1562 aa40.2■■■■■ 4.03
SLC30A3-201ENST00000233535 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.85■■■■□ 3.97
SLC30A3-201ENST00000233535 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
SLC30A3-201ENST00000233535 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.67■■■■□ 3.94
SLC30A3-201ENST00000233535 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.39■■■■□ 3.9
SLC30A3-201ENST00000233535 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.19■■■■□ 3.86
SLC30A3-201ENST00000233535 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC30A3-201ENST00000233535 WIZO95785 1651 aa38.94■■■■□ 3.82
SLC30A3-201ENST00000233535 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
SLC30A3-201ENST00000233535 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.66■■■■□ 3.78
SLC30A3-201ENST00000233535 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.6■■■■□ 3.77
SLC30A3-201ENST00000233535 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.6■■■■□ 3.77
SLC30A3-201ENST00000233535 SMARCA4P51532 1647 aa38.6■■■■□ 3.77
SLC30A3-201ENST00000233535 TRIM41Q8WV44 630 aa38.56■■■■□ 3.76
SLC30A3-201ENST00000233535 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
SLC30A3-201ENST00000233535 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.16■■■■□ 3.7
SLC30A3-201ENST00000233535 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
SLC30A3-201ENST00000233535 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
SLC30A3-201ENST00000233535 SMARCA2P51531 1590 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC30A3-201ENST00000233535 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.94■■■■□ 3.66
SLC30A3-201ENST00000233535 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.84■■■■□ 3.65
SLC30A3-201ENST00000233535 ABCC8Q09428 1581 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC30A3-201ENST00000233535 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC30A3-201ENST00000233535 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC30A3-201ENST00000233535 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
SLC30A3-201ENST00000233535 HRCP23327 699 aa37.36■■■■□ 3.57
SLC30A3-201ENST00000233535 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
SLC30A3-201ENST00000233535 SOGA1O94964 1423 aa37.31■■■■□ 3.56
SLC30A3-201ENST00000233535 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
SLC30A3-201ENST00000233535 NCAPD3P42695 1498 aa37.2■■■■□ 3.55
SLC30A3-201ENST00000233535 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.16■■■■□ 3.54
SLC30A3-201ENST00000233535 HMGXB3Q12766 1538 aa37.13■■■■□ 3.53
SLC30A3-201ENST00000233535 SYNJ1O43426 1573 aa37.11■■■■□ 3.53
SLC30A3-201ENST00000233535 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.07■■■■□ 3.52
SLC30A3-201ENST00000233535 EEA1Q15075 1411 aa37.06■■■■□ 3.52
SLC30A3-201ENST00000233535 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
SLC30A3-201ENST00000233535 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC30A3-201ENST00000233535 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
SLC30A3-201ENST00000233535 CEP162Q5TB80 1403 aa36.81■■■■□ 3.48
SLC30A3-201ENST00000233535 TOP2BQ02880 1626 aa36.76■■■■□ 3.47
SLC30A3-201ENST00000233535 GOLGA3Q08378 1498 aa36.74■■■■□ 3.47
SLC30A3-201ENST00000233535 CFTRP13569 1480 aa36.69■■■■□ 3.46
SLC30A3-201ENST00000233535 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.64■■■■□ 3.46
SLC30A3-201ENST00000233535 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC30A3-201ENST00000233535 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC30A3-201ENST00000233535 KIF21BO75037 1637 aa36.57■■■■□ 3.45
SLC30A3-201ENST00000233535 CUX1P39880 1505 aa36.53■■■■□ 3.44
SLC30A3-201ENST00000233535 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC30A3-201ENST00000233535 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.42■■■■□ 3.42
SLC30A3-201ENST00000233535 PRDM2Q13029 1718 aa36.37■■■■□ 3.41
SLC30A3-201ENST00000233535 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
SLC30A3-201ENST00000233535 CLIP1P30622 1438 aa36.28■■■■□ 3.4
SLC30A3-201ENST00000233535 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
SLC30A3-201ENST00000233535 KIF27Q86VH2 1401 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC30A3-201ENST00000233535 PRXQ9BXM0 1461 aa36.2■■■■□ 3.39
SLC30A3-201ENST00000233535 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
SLC30A3-201ENST00000233535 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.13■■■■□ 3.37
SLC30A3-201ENST00000233535 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC30A3-201ENST00000233535 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC30A3-201ENST00000233535 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.99■■■■□ 3.35
SLC30A3-201ENST00000233535 CUX2O14529 1486 aa35.98■■■■□ 3.35
SLC30A3-201ENST00000233535 NESP48681 1621 aa35.98■■■■□ 3.35
SLC30A3-201ENST00000233535 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
SLC30A3-201ENST00000233535 IGF1RP08069 1367 aa35.89■■■■□ 3.34
SLC30A3-201ENST00000233535 APLP2Q06481 763 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC30A3-201ENST00000233535 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC30A3-201ENST00000233535 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.33
SLC30A3-201ENST00000233535 ARAP1Q96P48 1450 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC30A3-201ENST00000233535 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.76■■■■□ 3.32
SLC30A3-201ENST00000233535 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC30A3-201ENST00000233535 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.71■■■■□ 3.31
SLC30A3-201ENST00000233535 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.71■■■■□ 3.31
SLC30A3-201ENST00000233535 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.7■■■■□ 3.31
SLC30A3-201ENST00000233535 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC30A3-201ENST00000233535 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC30A3-201ENST00000233535 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC30A3-201ENST00000233535 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
SLC30A3-201ENST00000233535 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
SLC30A3-201ENST00000233535 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC30A3-201ENST00000233535 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
SLC30A3-201ENST00000233535 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.37■■■■□ 3.25
SLC30A3-201ENST00000233535 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
SLC30A3-201ENST00000233535 WDR97A6NE52 1622 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC30A3-201ENST00000233535 CUL7Q14999 1698 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC30A3-201ENST00000233535 P3H3Q8IVL6 736 aa35.25■■■■□ 3.23
SLC30A3-201ENST00000233535 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.19■■■■□ 3.22
SLC30A3-201ENST00000233535 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.18■■■■□ 3.22
SLC30A3-201ENST00000233535 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
SLC30A3-201ENST00000233535 TIAM1Q13009 1591 aa35.09■■■■□ 3.21
SLC30A3-201ENST00000233535 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms