Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO39Q8N4B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO39Q8N4B4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO39Q8N4B4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms