RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344450.9

DUSP22-201, Transcript of dual specificity phosphatase 22, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP22, Length 1,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP22-201ENST00000344450 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.61■■■■■ 6.65
DUSP22-201ENST00000344450 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.03■■■■■ 5.6
DUSP22-201ENST00000344450 ABCC9O60706 1549 aa48.62■■■■■ 5.37
DUSP22-201ENST00000344450 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.27■■■■■ 5.16
DUSP22-201ENST00000344450 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
DUSP22-201ENST00000344450 NACADO15069 1562 aa46.98■■■■■ 5.11
DUSP22-201ENST00000344450 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.92■■■■■ 5.1
DUSP22-201ENST00000344450 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.84■■■■■ 5.09
DUSP22-201ENST00000344450 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.82■■■■■ 5.09
DUSP22-201ENST00000344450 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.78■■■■■ 4.92
DUSP22-201ENST00000344450 SCRIBQ14160 1630 aa45.77■■■■■ 4.92
DUSP22-201ENST00000344450 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.58■■■■■ 4.89
DUSP22-201ENST00000344450 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.46■■■■■ 4.87
DUSP22-201ENST00000344450 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.12■■■■■ 4.81
DUSP22-201ENST00000344450 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
DUSP22-201ENST00000344450 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.21■■■■■ 4.67
DUSP22-201ENST00000344450 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.07■■■■■ 4.65
DUSP22-201ENST00000344450 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.94■■■■■ 4.62
DUSP22-201ENST00000344450 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
DUSP22-201ENST00000344450 SMARCA4P51532 1647 aa43.79■■■■■ 4.6
DUSP22-201ENST00000344450 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.65■■■■■ 4.58
DUSP22-201ENST00000344450 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
DUSP22-201ENST00000344450 SMARCA2P51531 1590 aa43.43■■■■■ 4.54
DUSP22-201ENST00000344450 NCAPD3P42695 1498 aa43.37■■■■■ 4.53
DUSP22-201ENST00000344450 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
DUSP22-201ENST00000344450 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.34■■■■■ 4.53
DUSP22-201ENST00000344450 WIZO95785 1651 aa43.18■■■■■ 4.5
DUSP22-201ENST00000344450 HMGXB3Q12766 1538 aa43.17■■■■■ 4.5
DUSP22-201ENST00000344450 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
DUSP22-201ENST00000344450 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
DUSP22-201ENST00000344450 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
DUSP22-201ENST00000344450 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.28■■■■■ 4.36
DUSP22-201ENST00000344450 NESP48681 1621 aa42.2■■■■■ 4.35
DUSP22-201ENST00000344450 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.18■■■■■ 4.34
DUSP22-201ENST00000344450 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.12■■■■■ 4.33
DUSP22-201ENST00000344450 CFTRP13569 1480 aa41.99■■■■■ 4.31
DUSP22-201ENST00000344450 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.89■■■■■ 4.3
DUSP22-201ENST00000344450 ERCC6Q03468 1493 aa41.89■■■■■ 4.3
DUSP22-201ENST00000344450 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.67■■■■■ 4.26
DUSP22-201ENST00000344450 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.64■■■■■ 4.26
DUSP22-201ENST00000344450 PRDM2Q13029 1718 aa41.59■■■■■ 4.25
DUSP22-201ENST00000344450 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.57■■■■■ 4.24
DUSP22-201ENST00000344450 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.4■■■■■ 4.22
DUSP22-201ENST00000344450 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
DUSP22-201ENST00000344450 WDR62O43379 1518 aa41.21■■■■■ 4.19
DUSP22-201ENST00000344450 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
DUSP22-201ENST00000344450 CUX2O14529 1486 aa41.2■■■■■ 4.19
DUSP22-201ENST00000344450 ABCC8Q09428 1581 aa41.07■■■■■ 4.16
DUSP22-201ENST00000344450 TOPBP1Q92547 1522 aa41.04■■■■■ 4.16
DUSP22-201ENST00000344450 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.02■■■■■ 4.16
DUSP22-201ENST00000344450 CUX1P39880 1505 aa40.91■■■■■ 4.14
DUSP22-201ENST00000344450 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.88■■■■■ 4.13
DUSP22-201ENST00000344450 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
DUSP22-201ENST00000344450 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.71■■■■■ 4.11
DUSP22-201ENST00000344450 SYNJ1O43426 1573 aa40.69■■■■■ 4.1
DUSP22-201ENST00000344450 IFT140Q96RY7 1462 aa40.68■■■■■ 4.1
DUSP22-201ENST00000344450 TOP2BQ02880 1626 aa40.67■■■■■ 4.1
DUSP22-201ENST00000344450 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.63■■■■■ 4.09
DUSP22-201ENST00000344450 SOGA1O94964 1423 aa40.62■■■■■ 4.09
DUSP22-201ENST00000344450 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.58■■■■■ 4.09
DUSP22-201ENST00000344450 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
DUSP22-201ENST00000344450 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
DUSP22-201ENST00000344450 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
DUSP22-201ENST00000344450 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.33■■■■■ 4.05
DUSP22-201ENST00000344450 TRIM41Q8WV44 630 aa40.32■■■■■ 4.05
DUSP22-201ENST00000344450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.32■■■■■ 4.04
DUSP22-201ENST00000344450 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
DUSP22-201ENST00000344450 WDR97A6NE52 1622 aa40.25■■■■■ 4.03
DUSP22-201ENST00000344450 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.14■■■■■ 4.02
DUSP22-201ENST00000344450 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.13■■■■■ 4.02
DUSP22-201ENST00000344450 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.08■■■■■ 4.01
DUSP22-201ENST00000344450 GRIN2BQ13224 1484 aa40.06■■■■■ 4
DUSP22-201ENST00000344450 KIF27Q86VH2 1401 aa39.99■■■■□ 3.99
DUSP22-201ENST00000344450 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.93■■■■□ 3.98
DUSP22-201ENST00000344450 PBRM1Q86U86 1689 aa39.93■■■■□ 3.98
DUSP22-201ENST00000344450 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
DUSP22-201ENST00000344450 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.84■■■■□ 3.97
DUSP22-201ENST00000344450 FBLN2P98095 1184 aa39.83■■■■□ 3.97
DUSP22-201ENST00000344450 IGF1RP08069 1367 aa39.77■■■■□ 3.96
DUSP22-201ENST00000344450 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
DUSP22-201ENST00000344450 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.76■■■■□ 3.96
DUSP22-201ENST00000344450 SYNJ2O15056 1496 aa39.74■■■■□ 3.95
DUSP22-201ENST00000344450 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.69■■■■□ 3.94
DUSP22-201ENST00000344450 OSCARQ8IYS5 282 aa39.68■■■■□ 3.94
DUSP22-201ENST00000344450 ADAMTS12P58397 1594 aa39.68■■■■□ 3.94
DUSP22-201ENST00000344450 CHD1O14646 1710 aa39.65■■■■□ 3.94
DUSP22-201ENST00000344450 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.56■■■■□ 3.92
DUSP22-201ENST00000344450 CUL7Q14999 1698 aa39.55■■■■□ 3.92
DUSP22-201ENST00000344450 GRIN2AQ12879 1464 aa39.53■■■■□ 3.92
DUSP22-201ENST00000344450 EEA1Q15075 1411 aa39.53■■■■□ 3.92
DUSP22-201ENST00000344450 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
DUSP22-201ENST00000344450 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.48■■■■□ 3.91
DUSP22-201ENST00000344450 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.44■■■■□ 3.9
DUSP22-201ENST00000344450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.35■■■■□ 3.89
DUSP22-201ENST00000344450 NUP160Q12769 1436 aa39.33■■■■□ 3.89
DUSP22-201ENST00000344450 PRXQ9BXM0 1461 aa39.31■■■■□ 3.88
DUSP22-201ENST00000344450 CEP170Q5SW79 1584 aa39.28■■■■□ 3.88
DUSP22-201ENST00000344450 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.24■■■■□ 3.87
DUSP22-201ENST00000344450 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.1■■■■□ 3.85
DUSP22-201ENST00000344450 KIF21BO75037 1637 aa39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms