Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 512.17□□□□□ -0.463e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-219ENST00000557365 831 ntTSL 312.17□□□□□ -0.463e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-206ENST00000553681 899 ntTSL 312.14□□□□□ -0.473e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-215ENST00000557150 740 ntTSL 312.03□□□□□ -0.483e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-202ENST00000398030 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-220ENST00000557592 640 ntTSL 511.71□□□□□ -0.533e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-218ENST00000557344 671 ntTSL 210.96□□□□□ -0.653e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-18■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.133e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 RPS4X-204ENST00000486733 1820 ntTSL 58.01□□□□□ -1.131e-18■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 RPS4X-205ENST00000492695 355 ntTSL 37.43□□□□□ -1.221e-18■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 RPS4X-203ENST00000470671 610 ntTSL 33.4□□□□□ -1.871e-18■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 PBX2-204ENST00000495300 920 ntTSL 314.25□□□□□ -0.132e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-12■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.69e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 UBE2M-203ENST00000595957 734 ntTSL 215.27■□□□□ 0.049e-8■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.359e-9■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 SNF8-207ENST00000509995 560 ntTSL 312□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 SNF8-211ENST00000512243 863 ntTSL 29.63□□□□□ -0.871e-7■■□□□ 11.4
GRSF1Q12849 PBX2-202ENST00000478678 1320 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.362e-18■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.337e-7■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.447e-7■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.825e-44■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.815e-9■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.815e-9■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.465e-9■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.041e-16■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 521.26■□□□□ 0.995e-8■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)19.37■□□□□ 0.692e-10■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.415e-8■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.045e-9■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.285e-8■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-10■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-205ENST00000465744 710 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.372e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-204ENST00000465340 2240 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-HNRNPH2-202ENST00000409338 572 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-HNRNPH2-201ENST00000409170 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.87□□□□□ -0.992e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.12e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-201ENST00000372849 433 ntTSL 57.93□□□□□ -1.142e-23■□□□□ 11.3
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GRSF1Q12849 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-208ENST00000491851 547 ntTSL 24.96□□□□□ -1.622e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.722e-23■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-6■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.624e-8■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.814e-8■□□□□ 11.3
GRSF1Q12849 GPT2-203ENST00000562132 554 ntTSL 415.75■□□□□ 0.112e-7■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 GPT2-202ENST00000440783 4228 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.578e-11■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.468e-11■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.088e-11■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-11■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 COL9A3-204ENST00000463487 760 ntTSL 520.56■□□□□ 0.889e-7■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.413e-8■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 11.2
GRSF1Q12849 CIRBP-223ENST00000589266 616 ntTSL 325.47■■□□□ 1.676e-8■□□□□ 11.1
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GRSF1Q12849 CIRBP-236ENST00000592051 573 ntTSL 411.6□□□□□ -0.556e-8■□□□□ 11.1
GRSF1Q12849 BTBD7-207ENST00000554968 316 ntTSL 23.68□□□□□ -1.826e-8■□□□□ 11.1
GRSF1Q12849 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-7■□□□□ 11.1
GRSF1Q12849 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.725e-9■□□□□ 11.1
GRSF1Q12849 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.725e-9■□□□□ 11.1
GRSF1Q12849 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.725e-9■□□□□ 11.1
GRSF1Q12849 COL27A1-204ENST00000477421 3991 ntTSL 210.5□□□□□ -0.732e-9■□□□□ 11
GRSF1Q12849 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-9■□□□□ 11
GRSF1Q12849 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.576e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 COG8-202ENST00000562595 2262 ntTSL 520.16■□□□□ 0.825e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 COG8-203ENST00000564419 936 ntTSL 515.26■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.218e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.038e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.128e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-8■□□□□ 11
GRSF1Q12849 CASD1-204ENST00000447923 532 ntTSL 44.25□□□□□ -1.732e-8■□□□□ 11
GRSF1Q12849 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.656e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 MAP3K11-202ENST00000524848 2139 ntTSL 219.05■□□□□ 0.646e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.216e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.16e-7■□□□□ 11
GRSF1Q12849 CARHSP1-212ENST00000568968 461 ntTSL 215.59■□□□□ 0.092e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 23e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 526.47■■□□□ 1.833e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 526■■□□□ 1.753e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 525.29■■□□□ 1.643e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 525.13■■□□□ 1.613e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.543e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.483e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 323.17■■□□□ 1.33e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 222.41■■□□□ 1.183e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 522.25■■□□□ 1.153e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 521.33■■□□□ 1.013e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 218.99■□□□□ 0.633e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 318.99■□□□□ 0.633e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 518.35■□□□□ 0.533e-10■□□□□ 10.9
GRSF1Q12849 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.43e-10■□□□□ 10.9
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