RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592815.5

CIRBP-240, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene CIRBP, Length 334 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-240ENST00000592815 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.81■■■■□ 3.96
CIRBP-240ENST00000592815 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.52■■■■□ 3.28
CIRBP-240ENST00000592815 ABCC9O60706 1549 aa35.51■■■■□ 3.27
CIRBP-240ENST00000592815 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.81■■■■□ 3
CIRBP-240ENST00000592815 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.74■■■□□ 2.99
CIRBP-240ENST00000592815 NACADO15069 1562 aa33.63■■■□□ 2.97
CIRBP-240ENST00000592815 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.23■■■□□ 2.91
CIRBP-240ENST00000592815 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.2■■■□□ 2.91
CIRBP-240ENST00000592815 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.2■■■□□ 2.91
CIRBP-240ENST00000592815 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CIRBP-240ENST00000592815 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.93■■■□□ 2.86
CIRBP-240ENST00000592815 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.85■■■□□ 2.85
CIRBP-240ENST00000592815 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.8■■■□□ 2.84
CIRBP-240ENST00000592815 SCRIBQ14160 1630 aa32.48■■■□□ 2.79
CIRBP-240ENST00000592815 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.35■■■□□ 2.77
CIRBP-240ENST00000592815 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.01■■■□□ 2.72
CIRBP-240ENST00000592815 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
CIRBP-240ENST00000592815 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.96■■■□□ 2.71
CIRBP-240ENST00000592815 NCAPD3P42695 1498 aa31.09■■■□□ 2.57
CIRBP-240ENST00000592815 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.02■■■□□ 2.56
CIRBP-240ENST00000592815 SMARCA4P51532 1647 aa30.97■■■□□ 2.55
CIRBP-240ENST00000592815 SMARCA2P51531 1590 aa30.9■■■□□ 2.54
CIRBP-240ENST00000592815 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CIRBP-240ENST00000592815 HMGXB3Q12766 1538 aa30.79■■■□□ 2.52
CIRBP-240ENST00000592815 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CIRBP-240ENST00000592815 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.7■■■□□ 2.5
CIRBP-240ENST00000592815 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.65■■■□□ 2.5
CIRBP-240ENST00000592815 ERCC6Q03468 1493 aa30.64■■■□□ 2.5
CIRBP-240ENST00000592815 NESP48681 1621 aa30.55■■■□□ 2.48
CIRBP-240ENST00000592815 CUX2O14529 1486 aa30.47■■■□□ 2.47
CIRBP-240ENST00000592815 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.36■■■□□ 2.45
CIRBP-240ENST00000592815 WIZO95785 1651 aa30.3■■■□□ 2.44
CIRBP-240ENST00000592815 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.29■■■□□ 2.44
CIRBP-240ENST00000592815 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.2■■■□□ 2.42
CIRBP-240ENST00000592815 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.19■■■□□ 2.42
CIRBP-240ENST00000592815 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CIRBP-240ENST00000592815 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CIRBP-240ENST00000592815 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.04■■■□□ 2.4
CIRBP-240ENST00000592815 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CIRBP-240ENST00000592815 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.88■■■□□ 2.37
CIRBP-240ENST00000592815 CFTRP13569 1480 aa29.85■■■□□ 2.37
CIRBP-240ENST00000592815 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.81■■■□□ 2.36
CIRBP-240ENST00000592815 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.8■■■□□ 2.36
CIRBP-240ENST00000592815 WDR62O43379 1518 aa29.76■■■□□ 2.36
CIRBP-240ENST00000592815 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.67■■■□□ 2.34
CIRBP-240ENST00000592815 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CIRBP-240ENST00000592815 PRDM2Q13029 1718 aa29.37■■■□□ 2.29
CIRBP-240ENST00000592815 TOPBP1Q92547 1522 aa29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-240ENST00000592815 OSCARQ8IYS5 282 aa29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-240ENST00000592815 IFT140Q96RY7 1462 aa29.22■■■□□ 2.27
CIRBP-240ENST00000592815 ABCC8Q09428 1581 aa29.21■■■□□ 2.27
CIRBP-240ENST00000592815 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CIRBP-240ENST00000592815 TRIM41Q8WV44 630 aa29.15■■■□□ 2.26
CIRBP-240ENST00000592815 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.13■■■□□ 2.25
CIRBP-240ENST00000592815 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CIRBP-240ENST00000592815 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.232e-9■■■■■ 40.3
CIRBP-240ENST00000592815 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CIRBP-240ENST00000592815 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CIRBP-240ENST00000592815 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CIRBP-240ENST00000592815 SOGA1O94964 1423 aa28.91■■■□□ 2.22
CIRBP-240ENST00000592815 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.91■■■□□ 2.22
CIRBP-240ENST00000592815 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CIRBP-240ENST00000592815 FBLN2P98095 1184 aa28.83■■■□□ 2.21
CIRBP-240ENST00000592815 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.82■■■□□ 2.2
CIRBP-240ENST00000592815 CUX1P39880 1505 aa28.81■■■□□ 2.2
CIRBP-240ENST00000592815 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
CIRBP-240ENST00000592815 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
CIRBP-240ENST00000592815 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.69■■■□□ 2.18
CIRBP-240ENST00000592815 CHD1O14646 1710 aa28.65■■■□□ 2.18
CIRBP-240ENST00000592815 ARHGEF11O15085 1522 aa28.64■■■□□ 2.18
CIRBP-240ENST00000592815 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
CIRBP-240ENST00000592815 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.62■■■□□ 2.17
CIRBP-240ENST00000592815 WDR97A6NE52 1622 aa28.61■■■□□ 2.17
CIRBP-240ENST00000592815 GRIN2BQ13224 1484 aa28.59■■■□□ 2.17
CIRBP-240ENST00000592815 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.58■■■□□ 2.17
CIRBP-240ENST00000592815 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CIRBP-240ENST00000592815 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.53■■■□□ 2.16
CIRBP-240ENST00000592815 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.49■■■□□ 2.15
CIRBP-240ENST00000592815 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.151e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-240ENST00000592815 SYNJ2O15056 1496 aa28.46■■■□□ 2.15
CIRBP-240ENST00000592815 ARAP1Q96P48 1450 aa28.39■■■□□ 2.13
CIRBP-240ENST00000592815 SYNJ1O43426 1573 aa28.38■■■□□ 2.13
CIRBP-240ENST00000592815 TOP2BQ02880 1626 aa28.37■■■□□ 2.13
CIRBP-240ENST00000592815 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.37■■■□□ 2.13
CIRBP-240ENST00000592815 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.36■■■□□ 2.13
CIRBP-240ENST00000592815 PBRM1Q86U86 1689 aa28.36■■■□□ 2.13
CIRBP-240ENST00000592815 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.32■■■□□ 2.12
CIRBP-240ENST00000592815 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
CIRBP-240ENST00000592815 GRIN2AQ12879 1464 aa28.2■■■□□ 2.1
CIRBP-240ENST00000592815 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.18■■■□□ 2.1
CIRBP-240ENST00000592815 ADAMTS12P58397 1594 aa28.15■■■□□ 2.1
CIRBP-240ENST00000592815 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.12■■■□□ 2.09
CIRBP-240ENST00000592815 NUP160Q12769 1436 aa28.09■■■□□ 2.09
CIRBP-240ENST00000592815 CEP170Q5SW79 1584 aa28.07■■■□□ 2.08
CIRBP-240ENST00000592815 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.99■■■□□ 2.07
CIRBP-240ENST00000592815 JPH4Q96JJ6 628 aa27.93■■■□□ 2.06
CIRBP-240ENST00000592815 IGF1RP08069 1367 aa27.92■■■□□ 2.06
CIRBP-240ENST00000592815 KIF27Q86VH2 1401 aa27.92■■■□□ 2.06
CIRBP-240ENST00000592815 SHROOM2Q13796 1616 aa27.89■■■□□ 2.05
CIRBP-240ENST00000592815 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
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