RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588411.5

CIRBP-219, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene CIRBP, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-219ENST00000588411 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.68■■■■■ 6.18
CIRBP-219ENST00000588411 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.94■■■■■ 5.26
CIRBP-219ENST00000588411 ABCC9O60706 1549 aa47.45■■■■■ 5.19
CIRBP-219ENST00000588411 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.44■■■■■ 4.86
CIRBP-219ENST00000588411 NACADO15069 1562 aa45.25■■■■■ 4.83
CIRBP-219ENST00000588411 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.14■■■■■ 4.82
CIRBP-219ENST00000588411 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.8■■■■■ 4.76
CIRBP-219ENST00000588411 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
CIRBP-219ENST00000588411 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.4■■■■■ 4.7
CIRBP-219ENST00000588411 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.26■■■■■ 4.68
CIRBP-219ENST00000588411 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.23■■■■■ 4.67
CIRBP-219ENST00000588411 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.97■■■■■ 4.63
CIRBP-219ENST00000588411 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.97■■■■■ 4.63
CIRBP-219ENST00000588411 SCRIBQ14160 1630 aa43.7■■■■■ 4.59
CIRBP-219ENST00000588411 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.62■■■■■ 4.57
CIRBP-219ENST00000588411 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
CIRBP-219ENST00000588411 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.87■■■■■ 4.45
CIRBP-219ENST00000588411 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.73■■■■■ 4.43
CIRBP-219ENST00000588411 NCAPD3P42695 1498 aa41.75■■■■■ 4.27
CIRBP-219ENST00000588411 SMARCA4P51532 1647 aa41.74■■■■■ 4.27
CIRBP-219ENST00000588411 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.68■■■■■ 4.26
CIRBP-219ENST00000588411 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
CIRBP-219ENST00000588411 SMARCA2P51531 1590 aa41.64■■■■■ 4.26
CIRBP-219ENST00000588411 HMGXB3Q12766 1538 aa41.49■■■■■ 4.23
CIRBP-219ENST00000588411 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.35■■■■■ 4.21
CIRBP-219ENST00000588411 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.34■■■■■ 4.21
CIRBP-219ENST00000588411 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.32■■■■■ 4.2
CIRBP-219ENST00000588411 ERCC6Q03468 1493 aa41.02■■■■■ 4.16
CIRBP-219ENST00000588411 NESP48681 1621 aa40.85■■■■■ 4.13
CIRBP-219ENST00000588411 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.12
CIRBP-219ENST00000588411 CUX2O14529 1486 aa40.76■■■■■ 4.12
CIRBP-219ENST00000588411 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.74■■■■■ 4.11
CIRBP-219ENST00000588411 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
CIRBP-219ENST00000588411 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.55■■■■■ 4.08
CIRBP-219ENST00000588411 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.53■■■■■ 4.08
CIRBP-219ENST00000588411 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
CIRBP-219ENST00000588411 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CIRBP-219ENST00000588411 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.32■■■■■ 4.05
CIRBP-219ENST00000588411 CFTRP13569 1480 aa40.15■■■■■ 4.02
CIRBP-219ENST00000588411 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.13■■■■■ 4.01
CIRBP-219ENST00000588411 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.12■■■■■ 4.01
CIRBP-219ENST00000588411 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.07■■■■■ 4.01
CIRBP-219ENST00000588411 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.06■■■■■ 4
CIRBP-219ENST00000588411 WDR62O43379 1518 aa39.97■■■■□ 3.99
CIRBP-219ENST00000588411 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.94■■■■□ 3.98
CIRBP-219ENST00000588411 PRDM2Q13029 1718 aa39.72■■■■□ 3.95
CIRBP-219ENST00000588411 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
CIRBP-219ENST00000588411 ABCC8Q09428 1581 aa39.38■■■■□ 3.89
CIRBP-219ENST00000588411 TOPBP1Q92547 1522 aa39.33■■■■□ 3.89
CIRBP-219ENST00000588411 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
CIRBP-219ENST00000588411 IFT140Q96RY7 1462 aa39.26■■■■□ 3.88
CIRBP-219ENST00000588411 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.25■■■■□ 3.87
CIRBP-219ENST00000588411 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
CIRBP-219ENST00000588411 OSCARQ8IYS5 282 aa39■■■■□ 3.83
CIRBP-219ENST00000588411 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
CIRBP-219ENST00000588411 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
CIRBP-219ENST00000588411 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
CIRBP-219ENST00000588411 SOGA1O94964 1423 aa38.83■■■■□ 3.81
CIRBP-219ENST00000588411 CUX1P39880 1505 aa38.81■■■■□ 3.8
CIRBP-219ENST00000588411 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.82e-9■■■■■ 40.3
CIRBP-219ENST00000588411 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.79■■■■□ 3.8
CIRBP-219ENST00000588411 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.79■■■■□ 3.8
CIRBP-219ENST00000588411 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CIRBP-219ENST00000588411 WDR97A6NE52 1622 aa38.64■■■■□ 3.78
CIRBP-219ENST00000588411 TRIM41Q8WV44 630 aa38.6■■■■□ 3.77
CIRBP-219ENST00000588411 FBLN2P98095 1184 aa38.52■■■■□ 3.76
CIRBP-219ENST00000588411 CHD1O14646 1710 aa38.46■■■■□ 3.75
CIRBP-219ENST00000588411 GRIN2BQ13224 1484 aa38.45■■■■□ 3.75
CIRBP-219ENST00000588411 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.45■■■■□ 3.75
CIRBP-219ENST00000588411 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.42■■■■□ 3.741e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-219ENST00000588411 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
CIRBP-219ENST00000588411 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.4■■■■□ 3.74
CIRBP-219ENST00000588411 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.37■■■■□ 3.73
CIRBP-219ENST00000588411 TOP2BQ02880 1626 aa38.34■■■■□ 3.73
CIRBP-219ENST00000588411 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.34■■■■□ 3.73
CIRBP-219ENST00000588411 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.32■■■■□ 3.73
CIRBP-219ENST00000588411 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.32■■■■□ 3.73
CIRBP-219ENST00000588411 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.32■■■■□ 3.73
CIRBP-219ENST00000588411 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.31■■■■□ 3.72
CIRBP-219ENST00000588411 ARHGEF11O15085 1522 aa38.3■■■■□ 3.72
CIRBP-219ENST00000588411 SYNJ1O43426 1573 aa38.27■■■■□ 3.72
CIRBP-219ENST00000588411 SYNJ2O15056 1496 aa38.26■■■■□ 3.72
CIRBP-219ENST00000588411 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.25■■■■□ 3.71
CIRBP-219ENST00000588411 PBRM1Q86U86 1689 aa38.23■■■■□ 3.71
CIRBP-219ENST00000588411 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.07■■■■□ 3.69
CIRBP-219ENST00000588411 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.02■■■■□ 3.68
CIRBP-219ENST00000588411 ADAMTS12P58397 1594 aa37.95■■■■□ 3.67
CIRBP-219ENST00000588411 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.94■■■■□ 3.66
CIRBP-219ENST00000588411 ARAP1Q96P48 1450 aa37.94■■■■□ 3.66
CIRBP-219ENST00000588411 GRIN2AQ12879 1464 aa37.93■■■■□ 3.66
CIRBP-219ENST00000588411 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.92■■■■□ 3.66
CIRBP-219ENST00000588411 NUP160Q12769 1436 aa37.78■■■■□ 3.64
CIRBP-219ENST00000588411 CEP170Q5SW79 1584 aa37.71■■■■□ 3.63
CIRBP-219ENST00000588411 KIF27Q86VH2 1401 aa37.7■■■■□ 3.62
CIRBP-219ENST00000588411 IGF1RP08069 1367 aa37.55■■■■□ 3.6
CIRBP-219ENST00000588411 SHROOM2Q13796 1616 aa37.5■■■■□ 3.59
CIRBP-219ENST00000588411 CUL7Q14999 1698 aa37.48■■■■□ 3.59
CIRBP-219ENST00000588411 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
CIRBP-219ENST00000588411 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.46■■■■□ 3.59
CIRBP-219ENST00000588411 JPH4Q96JJ6 628 aa37.42■■■■□ 3.58
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