Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NIPSNAP1Q9BPW8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms