RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371789.7

C9orf116-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf116, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-202ENST00000371789 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.44■■■■■ 4.22
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C9orf116-202ENST00000371789 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.18■■■□□ 2.9
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C9orf116-202ENST00000371789 CFTRP13569 1480 aa30.98■■■□□ 2.55
C9orf116-202ENST00000371789 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.95■■■□□ 2.55
C9orf116-202ENST00000371789 WDR62O43379 1518 aa30.92■■■□□ 2.54
C9orf116-202ENST00000371789 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.89■■■□□ 2.53
C9orf116-202ENST00000371789 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.88■■■□□ 2.53
C9orf116-202ENST00000371789 PRDM2Q13029 1718 aa30.84■■■□□ 2.53
C9orf116-202ENST00000371789 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.81■■■□□ 2.52
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C9orf116-202ENST00000371789 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.26■■■□□ 2.27
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C9orf116-202ENST00000371789 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.22■■■□□ 2.27
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C9orf116-202ENST00000371789 CEP170Q5SW79 1584 aa29.18■■■□□ 2.26
C9orf116-202ENST00000371789 NUP160Q12769 1436 aa29.16■■■□□ 2.26
C9orf116-202ENST00000371789 SHROOM2Q13796 1616 aa29.06■■■□□ 2.24
C9orf116-202ENST00000371789 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.05■■■□□ 2.24
C9orf116-202ENST00000371789 KIF27Q86VH2 1401 aa28.95■■■□□ 2.23
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C9orf116-202ENST00000371789 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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