RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359751.8

EFNA4-201, Transcript of ephrin A4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFNA4, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4-201ENST00000359751 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.17■■■■□ 3.7
EFNA4-201ENST00000359751 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.97■■■■□ 3.03
EFNA4-201ENST00000359751 ABCC9O60706 1549 aa32.77■■■□□ 2.84
EFNA4-201ENST00000359751 NACADO15069 1562 aa31.87■■■□□ 2.69
EFNA4-201ENST00000359751 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
EFNA4-201ENST00000359751 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.83■■■□□ 2.69
EFNA4-201ENST00000359751 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.82■■■□□ 2.68
EFNA4-201ENST00000359751 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.73■■■□□ 2.67
EFNA4-201ENST00000359751 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.66■■■□□ 2.66
EFNA4-201ENST00000359751 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.98■■■□□ 2.55
EFNA4-201ENST00000359751 SCRIBQ14160 1630 aa30.83■■■□□ 2.53
EFNA4-201ENST00000359751 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.7■■■□□ 2.51
EFNA4-201ENST00000359751 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.69■■■□□ 2.5
EFNA4-201ENST00000359751 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
EFNA4-201ENST00000359751 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
EFNA4-201ENST00000359751 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.73■■■□□ 2.35
EFNA4-201ENST00000359751 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.7■■■□□ 2.35
EFNA4-201ENST00000359751 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
EFNA4-201ENST00000359751 SMARCA4P51532 1647 aa29.58■■■□□ 2.33
EFNA4-201ENST00000359751 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.57■■■□□ 2.32
EFNA4-201ENST00000359751 SMARCA2P51531 1590 aa29.43■■■□□ 2.3
EFNA4-201ENST00000359751 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.36■■■□□ 2.29
EFNA4-201ENST00000359751 NCAPD3P42695 1498 aa29.34■■■□□ 2.29
EFNA4-201ENST00000359751 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.34■■■□□ 2.29
EFNA4-201ENST00000359751 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.33■■■□□ 2.29
EFNA4-201ENST00000359751 HMGXB3Q12766 1538 aa29.27■■■□□ 2.28
EFNA4-201ENST00000359751 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
EFNA4-201ENST00000359751 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
EFNA4-201ENST00000359751 WIZO95785 1651 aa29.03■■■□□ 2.24
EFNA4-201ENST00000359751 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
EFNA4-201ENST00000359751 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.58■■■□□ 2.17
EFNA4-201ENST00000359751 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.48■■■□□ 2.15
EFNA4-201ENST00000359751 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
EFNA4-201ENST00000359751 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.42■■■□□ 2.14
EFNA4-201ENST00000359751 NESP48681 1621 aa28.39■■■□□ 2.13
EFNA4-201ENST00000359751 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.38■■■□□ 2.13
EFNA4-201ENST00000359751 CFTRP13569 1480 aa28.36■■■□□ 2.13
EFNA4-201ENST00000359751 ERCC6Q03468 1493 aa28.36■■■□□ 2.13
EFNA4-201ENST00000359751 PRDM2Q13029 1718 aa28.26■■■□□ 2.12
EFNA4-201ENST00000359751 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.16■■■□□ 2.1
EFNA4-201ENST00000359751 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.14■■■□□ 2.09
EFNA4-201ENST00000359751 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.13■■■□□ 2.09
EFNA4-201ENST00000359751 CUX2O14529 1486 aa28.05■■■□□ 2.08
EFNA4-201ENST00000359751 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
EFNA4-201ENST00000359751 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.02■■■□□ 2.08
EFNA4-201ENST00000359751 WDR62O43379 1518 aa27.92■■■□□ 2.06
EFNA4-201ENST00000359751 ABCC8Q09428 1581 aa27.88■■■□□ 2.05
EFNA4-201ENST00000359751 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
EFNA4-201ENST00000359751 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.74■■■□□ 2.03
EFNA4-201ENST00000359751 TOPBP1Q92547 1522 aa27.7■■■□□ 2.02
EFNA4-201ENST00000359751 IFT140Q96RY7 1462 aa27.55■■■□□ 2
EFNA4-201ENST00000359751 CUX1P39880 1505 aa27.53■■■□□ 2
EFNA4-201ENST00000359751 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
EFNA4-201ENST00000359751 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
EFNA4-201ENST00000359751 TOP2BQ02880 1626 aa27.45■■□□□ 1.98
EFNA4-201ENST00000359751 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.45■■□□□ 1.98
EFNA4-201ENST00000359751 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.44■■□□□ 1.98
EFNA4-201ENST00000359751 WDR97A6NE52 1622 aa27.38■■□□□ 1.97
EFNA4-201ENST00000359751 SOGA1O94964 1423 aa27.37■■□□□ 1.97
EFNA4-201ENST00000359751 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
EFNA4-201ENST00000359751 SYNJ1O43426 1573 aa27.35■■□□□ 1.97
EFNA4-201ENST00000359751 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.25■■□□□ 1.95
EFNA4-201ENST00000359751 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.25■■□□□ 1.95
EFNA4-201ENST00000359751 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
EFNA4-201ENST00000359751 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
EFNA4-201ENST00000359751 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
EFNA4-201ENST00000359751 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
EFNA4-201ENST00000359751 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.09■■□□□ 1.93
EFNA4-201ENST00000359751 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.09■■□□□ 1.93
EFNA4-201ENST00000359751 GRIN2BQ13224 1484 aa27.08■■□□□ 1.93
EFNA4-201ENST00000359751 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
EFNA4-201ENST00000359751 PBRM1Q86U86 1689 aa27.02■■□□□ 1.92
EFNA4-201ENST00000359751 TRIM41Q8WV44 630 aa26.99■■□□□ 1.91
EFNA4-201ENST00000359751 KIF27Q86VH2 1401 aa26.98■■□□□ 1.91
EFNA4-201ENST00000359751 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
EFNA4-201ENST00000359751 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.93■■□□□ 1.9
EFNA4-201ENST00000359751 SYNJ2O15056 1496 aa26.88■■□□□ 1.89
EFNA4-201ENST00000359751 OSCARQ8IYS5 282 aa26.85■■□□□ 1.89
EFNA4-201ENST00000359751 CHD1O14646 1710 aa26.84■■□□□ 1.89
EFNA4-201ENST00000359751 ADAMTS12P58397 1594 aa26.82■■□□□ 1.88
EFNA4-201ENST00000359751 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.82■■□□□ 1.88
EFNA4-201ENST00000359751 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
EFNA4-201ENST00000359751 CUL7Q14999 1698 aa26.8■■□□□ 1.88
EFNA4-201ENST00000359751 FBLN2P98095 1184 aa26.77■■□□□ 1.88
EFNA4-201ENST00000359751 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.77■■□□□ 1.88
EFNA4-201ENST00000359751 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.72■■□□□ 1.87
EFNA4-201ENST00000359751 IGF1RP08069 1367 aa26.71■■□□□ 1.87
EFNA4-201ENST00000359751 EEA1Q15075 1411 aa26.71■■□□□ 1.87
EFNA4-201ENST00000359751 GRIN2AQ12879 1464 aa26.7■■□□□ 1.87
EFNA4-201ENST00000359751 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.61■■□□□ 1.85
EFNA4-201ENST00000359751 NUP160Q12769 1436 aa26.58■■□□□ 1.85
EFNA4-201ENST00000359751 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.56■■□□□ 1.84
EFNA4-201ENST00000359751 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
EFNA4-201ENST00000359751 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.52■■□□□ 1.84
EFNA4-201ENST00000359751 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
EFNA4-201ENST00000359751 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.47■■□□□ 1.83
EFNA4-201ENST00000359751 PRXQ9BXM0 1461 aa26.45■■□□□ 1.82
EFNA4-201ENST00000359751 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.41■■□□□ 1.82
EFNA4-201ENST00000359751 ARHGEF11O15085 1522 aa26.39■■□□□ 1.81
EFNA4-201ENST00000359751 SHROOM2Q13796 1616 aa26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.5 ms