RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523213.1

ZBED8-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED8, Length 2,484 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED8-202ENST00000523213 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.04■■■□□ 2.72
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ZBED8-202ENST00000523213 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.02■■□□□ 1.92
ZBED8-202ENST00000523213 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
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ZBED8-202ENST00000523213 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
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ZBED8-202ENST00000523213 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.65■■□□□ 1.7
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ZBED8-202ENST00000523213 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.25■■□□□ 1.63
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ZBED8-202ENST00000523213 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.15■■□□□ 1.62
ZBED8-202ENST00000523213 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.1■■□□□ 1.61
ZBED8-202ENST00000523213 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.93■■□□□ 1.58
ZBED8-202ENST00000523213 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.93■■□□□ 1.58
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ZBED8-202ENST00000523213 WIZO95785 1651 aa24.77■■□□□ 1.56
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ZBED8-202ENST00000523213 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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ZBED8-202ENST00000523213 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.46■■□□□ 1.51
ZBED8-202ENST00000523213 TRIM41Q8WV44 630 aa24.39■■□□□ 1.49
ZBED8-202ENST00000523213 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
ZBED8-202ENST00000523213 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ZBED8-202ENST00000523213 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.24■■□□□ 1.47
ZBED8-202ENST00000523213 SMARCA2P51531 1590 aa24.19■■□□□ 1.46
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ZBED8-202ENST00000523213 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.13■■□□□ 1.45
ZBED8-202ENST00000523213 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.04■■□□□ 1.44
ZBED8-202ENST00000523213 ABCC8Q09428 1581 aa24.03■■□□□ 1.44
ZBED8-202ENST00000523213 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.03■■□□□ 1.44
ZBED8-202ENST00000523213 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ZBED8-202ENST00000523213 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.81■■□□□ 1.4
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ZBED8-202ENST00000523213 NCAPD3P42695 1498 aa23.64■■□□□ 1.38
ZBED8-202ENST00000523213 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.63■■□□□ 1.37
ZBED8-202ENST00000523213 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
ZBED8-202ENST00000523213 SYNJ1O43426 1573 aa23.57■■□□□ 1.36
ZBED8-202ENST00000523213 HMGXB3Q12766 1538 aa23.57■■□□□ 1.36
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ZBED8-202ENST00000523213 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.44■■□□□ 1.34
ZBED8-202ENST00000523213 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.42■■□□□ 1.34
ZBED8-202ENST00000523213 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ZBED8-202ENST00000523213 HRCP23327 699 aa23.33■■□□□ 1.33
ZBED8-202ENST00000523213 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
ZBED8-202ENST00000523213 EEA1Q15075 1411 aa23.31■■□□□ 1.32
ZBED8-202ENST00000523213 CFTRP13569 1480 aa23.3■■□□□ 1.32
ZBED8-202ENST00000523213 TOP2BQ02880 1626 aa23.28■■□□□ 1.32
ZBED8-202ENST00000523213 CEP162Q5TB80 1403 aa23.25■■□□□ 1.31
ZBED8-202ENST00000523213 CUX1P39880 1505 aa23.23■■□□□ 1.31
ZBED8-202ENST00000523213 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.22■■□□□ 1.31
ZBED8-202ENST00000523213 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.2■■□□□ 1.3
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ZBED8-202ENST00000523213 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.17■■□□□ 1.3
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ZBED8-202ENST00000523213 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.11■■□□□ 1.29
ZBED8-202ENST00000523213 KIF21BO75037 1637 aa23.07■■□□□ 1.28
ZBED8-202ENST00000523213 NESP48681 1621 aa23.06■■□□□ 1.28
ZBED8-202ENST00000523213 PRDM2Q13029 1718 aa23.05■■□□□ 1.28
ZBED8-202ENST00000523213 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.96■■□□□ 1.27
ZBED8-202ENST00000523213 CLIP1P30622 1438 aa22.94■■□□□ 1.26
ZBED8-202ENST00000523213 KIF27Q86VH2 1401 aa22.93■■□□□ 1.26
ZBED8-202ENST00000523213 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.9■■□□□ 1.26
ZBED8-202ENST00000523213 PRXQ9BXM0 1461 aa22.9■■□□□ 1.26
ZBED8-202ENST00000523213 CUX2O14529 1486 aa22.88■■□□□ 1.25
ZBED8-202ENST00000523213 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.79■■□□□ 1.24
ZBED8-202ENST00000523213 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.79■■□□□ 1.24
ZBED8-202ENST00000523213 IGF1RP08069 1367 aa22.78■■□□□ 1.24
ZBED8-202ENST00000523213 TOPBP1Q92547 1522 aa22.75■■□□□ 1.23
ZBED8-202ENST00000523213 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.73■■□□□ 1.23
ZBED8-202ENST00000523213 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
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ZBED8-202ENST00000523213 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.58■■□□□ 1.2
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ZBED8-202ENST00000523213 WDR97A6NE52 1622 aa22.43■■□□□ 1.18
ZBED8-202ENST00000523213 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.37■■□□□ 1.17
ZBED8-202ENST00000523213 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.36■■□□□ 1.17
ZBED8-202ENST00000523213 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
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ZBED8-202ENST00000523213 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ZBED8-202ENST00000523213 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
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