Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-219ENST00000568989 498 ntTSL 214.99□□□□□ -0.013e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.089e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.199e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 FAM96A-205ENST00000559705 636 ntTSL 313.51□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 FAM96A-202ENST00000380290 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.353e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.969e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 CNOT1-204ENST00000563130 2280 ntTSL 26.69□□□□□ -1.343e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.493e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.733e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.873e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 CNOT1-221ENST00000569924 493 ntTSL 23.18□□□□□ -1.93e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 22.46□□□□□ -2.013e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 21.55□□□□□ -2.163e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.561e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.111e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.361e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.791e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.811e-7■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-7■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-211ENST00000598814 550 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.384e-14■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.024e-14■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.544e-14■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.714e-14■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-14■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.734e-14■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt17.34■□□□□ 0.372e-12■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-12■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-12■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-12■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.832e-12■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-7■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-7■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.14e-6■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-207ENST00000476004 502 ntTSL 316.59■□□□□ 0.259e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-219ENST00000528406 393 ntTSL 314.59□□□□□ -0.079e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.739e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 59.32□□□□□ -0.929e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.099e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.099e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.189e-11■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.218e-20■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 310.81□□□□□ -0.688e-20■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.88e-20■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.838e-20■■□□□ 12
APOBEC3CQ9NRW3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.382e-13■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.038e-14■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-211ENST00000514842 2153 ntTSL 510.86□□□□□ -0.678e-14■■□□□ 11.9
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APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-210ENST00000511643 618 ntTSL 23.98□□□□□ -1.778e-14■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.798e-14■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-207ENST00000506581 371 ntTSL 53.31□□□□□ -1.888e-14■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPL9-208ENST00000508595 667 ntTSL 33.21□□□□□ -1.98e-14■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 HDDC2-201ENST00000318787 1350 ntTSL 1 (best)17.53■□□□□ 0.42e-7■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 HDDC2-209ENST00000609477 564 ntTSL 415.55■□□□□ 0.082e-7■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 HDDC2-205ENST00000608456 624 ntTSL 35.97□□□□□ -1.452e-7■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 HDDC2-208ENST00000609021 3529 nt4.62□□□□□ -1.672e-7■■□□□ 11.9
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.024e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.564e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.494e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 423.59■■□□□ 1.374e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.354e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.294e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 322.96■■□□□ 1.274e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MPG-202ENST00000356432 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.914e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.854e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAH-205ENST00000471374 1735 ntTSL 220.03■□□□□ 0.84e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.764e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.634e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-204ENST00000540949 343 ntTSL 218.89■□□□□ 0.614e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MPG-204ENST00000436333 884 ntTSL 218.5■□□□□ 0.554e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.364e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 216.39■□□□□ 0.214e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.214e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 R3HDM4-207ENST00000591829 823 ntTSL 514.89□□□□□ -0.034e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PRKCSH-208ENST00000589126 625 ntTSL 514.76□□□□□ -0.054e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 214.26□□□□□ -0.134e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.194e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 513.36□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.284e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 11.8
APOBEC3CQ9NRW3 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■□□□ 11.8
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