Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT88Q13099 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT88Q13099 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT88Q13099 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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