RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219150.9

CORO1A-201, Transcript of coronin 1A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CORO1A, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1A-201ENST00000219150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.25■■■■■ 5.8
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CORO1A-201ENST00000219150 ABCC9O60706 1549 aa42.91■■■■■ 4.46
CORO1A-201ENST00000219150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.56■■■■■ 4.4
CORO1A-201ENST00000219150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.36■■■■■ 4.37
CORO1A-201ENST00000219150 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
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CORO1A-201ENST00000219150 SCRIBQ14160 1630 aa41.28■■■■■ 4.2
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CORO1A-201ENST00000219150 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.03■■■■□ 3.84
CORO1A-201ENST00000219150 SMARCA2P51531 1590 aa38.97■■■■□ 3.83
CORO1A-201ENST00000219150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.96■■■■□ 3.83
CORO1A-201ENST00000219150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.84■■■■□ 3.81
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CORO1A-201ENST00000219150 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.69■■■■□ 3.62
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CORO1A-201ENST00000219150 NESP48681 1621 aa37.52■■■■□ 3.6
CORO1A-201ENST00000219150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.51■■■■□ 3.6
CORO1A-201ENST00000219150 ABCC8Q09428 1581 aa37.48■■■■□ 3.59
CORO1A-201ENST00000219150 TRIM41Q8WV44 630 aa37.39■■■■□ 3.58
CORO1A-201ENST00000219150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.29■■■■□ 3.56
CORO1A-201ENST00000219150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
CORO1A-201ENST00000219150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.23■■■■□ 3.55
CORO1A-201ENST00000219150 SYNJ1O43426 1573 aa37.15■■■■□ 3.54
CORO1A-201ENST00000219150 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.12■■■■□ 3.53
CORO1A-201ENST00000219150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.11■■■■□ 3.53
CORO1A-201ENST00000219150 TOP2BQ02880 1626 aa37.04■■■■□ 3.52
CORO1A-201ENST00000219150 CUX1P39880 1505 aa37.04■■■■□ 3.52
CORO1A-201ENST00000219150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.02■■■■□ 3.52
CORO1A-201ENST00000219150 ERCC6Q03468 1493 aa36.88■■■■□ 3.49
CORO1A-201ENST00000219150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.87■■■■□ 3.49
CORO1A-201ENST00000219150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
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CORO1A-201ENST00000219150 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.77■■■■□ 3.48
CORO1A-201ENST00000219150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.72■■■■□ 3.47
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CORO1A-201ENST00000219150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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CORO1A-201ENST00000219150 EEA1Q15075 1411 aa36.5■■■■□ 3.43
CORO1A-201ENST00000219150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.48■■■■□ 3.43
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CORO1A-201ENST00000219150 KIF27Q86VH2 1401 aa36.39■■■■□ 3.42
CORO1A-201ENST00000219150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.38■■■■□ 3.41
CORO1A-201ENST00000219150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.35■■■■□ 3.41
CORO1A-201ENST00000219150 WDR97A6NE52 1622 aa36.32■■■■□ 3.4
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CORO1A-201ENST00000219150 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.1■■■■□ 3.37
CORO1A-201ENST00000219150 IGF1RP08069 1367 aa36.08■■■■□ 3.37
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CORO1A-201ENST00000219150 PBRM1Q86U86 1689 aa35.97■■■■□ 3.35
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CORO1A-201ENST00000219150 CUL7Q14999 1698 aa35.91■■■■□ 3.34
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CORO1A-201ENST00000219150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.68■■■■□ 3.3
CORO1A-201ENST00000219150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CORO1A-201ENST00000219150 CEP162Q5TB80 1403 aa35.55■■■■□ 3.28
CORO1A-201ENST00000219150 HRCP23327 699 aa35.52■■■■□ 3.28
CORO1A-201ENST00000219150 SYNJ2O15056 1496 aa35.5■■■■□ 3.27
CORO1A-201ENST00000219150 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.48■■■■□ 3.27
CORO1A-201ENST00000219150 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.47■■■■□ 3.27
CORO1A-201ENST00000219150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
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