RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433161.1

HAR1A-201, Transcript of highly accelerated region 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HAR1A, Length 1,882 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAR1A-201ENST00000433161 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.79■■■■■ 6.04
HAR1A-201ENST00000433161 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.5■■■■■ 5.03
HAR1A-201ENST00000433161 ABCC9O60706 1549 aa44.53■■■■■ 4.72
HAR1A-201ENST00000433161 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
HAR1A-201ENST00000433161 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.7■■■■■ 4.59
HAR1A-201ENST00000433161 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.7■■■■■ 4.59
HAR1A-201ENST00000433161 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.49■■■■■ 4.55
HAR1A-201ENST00000433161 NACADO15069 1562 aa43.44■■■■■ 4.55
HAR1A-201ENST00000433161 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.26■■■■■ 4.52
HAR1A-201ENST00000433161 SCRIBQ14160 1630 aa42.54■■■■■ 4.4
HAR1A-201ENST00000433161 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.41■■■■■ 4.38
HAR1A-201ENST00000433161 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.37■■■■■ 4.37
HAR1A-201ENST00000433161 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.94■■■■■ 4.3
HAR1A-201ENST00000433161 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.77■■■■■ 4.28
HAR1A-201ENST00000433161 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.03■■■■■ 4.16
HAR1A-201ENST00000433161 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
HAR1A-201ENST00000433161 SMARCA4P51532 1647 aa40.77■■■■■ 4.12
HAR1A-201ENST00000433161 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
HAR1A-201ENST00000433161 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.72■■■■■ 4.11
HAR1A-201ENST00000433161 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
HAR1A-201ENST00000433161 WIZO95785 1651 aa40.37■■■■■ 4.05
HAR1A-201ENST00000433161 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
HAR1A-201ENST00000433161 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.34■■■■■ 4.05
HAR1A-201ENST00000433161 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.33■■■■■ 4.05
HAR1A-201ENST00000433161 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.26■■■■■ 4.04
HAR1A-201ENST00000433161 SMARCA2P51531 1590 aa40.26■■■■■ 4.03
HAR1A-201ENST00000433161 NCAPD3P42695 1498 aa40.06■■■■■ 4
HAR1A-201ENST00000433161 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
HAR1A-201ENST00000433161 HMGXB3Q12766 1538 aa39.98■■■■□ 3.99
HAR1A-201ENST00000433161 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
HAR1A-201ENST00000433161 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.93■■■■□ 3.98
HAR1A-201ENST00000433161 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.48■■■■□ 3.91
HAR1A-201ENST00000433161 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.96■■■■□ 3.83
HAR1A-201ENST00000433161 CFTRP13569 1480 aa38.95■■■■□ 3.83
HAR1A-201ENST00000433161 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.87■■■■□ 3.81
HAR1A-201ENST00000433161 NESP48681 1621 aa38.85■■■■□ 3.81
HAR1A-201ENST00000433161 PRDM2Q13029 1718 aa38.83■■■■□ 3.81
HAR1A-201ENST00000433161 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.54■■■■□ 3.76
HAR1A-201ENST00000433161 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.53■■■■□ 3.76
HAR1A-201ENST00000433161 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.46■■■■□ 3.75
HAR1A-201ENST00000433161 ABCC8Q09428 1581 aa38.4■■■■□ 3.74
HAR1A-201ENST00000433161 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.38■■■■□ 3.74
HAR1A-201ENST00000433161 ERCC6Q03468 1493 aa38.28■■■■□ 3.72
HAR1A-201ENST00000433161 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.26■■■■□ 3.71
HAR1A-201ENST00000433161 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.25■■■■□ 3.71
HAR1A-201ENST00000433161 SYNJ1O43426 1573 aa38.15■■■■□ 3.7
HAR1A-201ENST00000433161 CUX1P39880 1505 aa38.14■■■■□ 3.7
HAR1A-201ENST00000433161 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.1■■■■□ 3.69
HAR1A-201ENST00000433161 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
HAR1A-201ENST00000433161 TOP2BQ02880 1626 aa38.09■■■■□ 3.69
HAR1A-201ENST00000433161 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.08■■■■□ 3.69
HAR1A-201ENST00000433161 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.08■■■■□ 3.69
HAR1A-201ENST00000433161 TRIM41Q8WV44 630 aa38.05■■■■□ 3.68
HAR1A-201ENST00000433161 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
HAR1A-201ENST00000433161 TOPBP1Q92547 1522 aa38.03■■■■□ 3.68
HAR1A-201ENST00000433161 WDR62O43379 1518 aa37.96■■■■□ 3.67
HAR1A-201ENST00000433161 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.84■■■■□ 3.65
HAR1A-201ENST00000433161 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
HAR1A-201ENST00000433161 CUX2O14529 1486 aa37.62■■■■□ 3.61
HAR1A-201ENST00000433161 SOGA1O94964 1423 aa37.62■■■■□ 3.61
HAR1A-201ENST00000433161 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.61■■■■□ 3.61
HAR1A-201ENST00000433161 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
HAR1A-201ENST00000433161 WDR97A6NE52 1622 aa37.52■■■■□ 3.6
HAR1A-201ENST00000433161 IFT140Q96RY7 1462 aa37.51■■■■□ 3.6
HAR1A-201ENST00000433161 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.51■■■■□ 3.6
HAR1A-201ENST00000433161 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.39■■■■□ 3.58
HAR1A-201ENST00000433161 KIF27Q86VH2 1401 aa37.36■■■■□ 3.57
HAR1A-201ENST00000433161 EEA1Q15075 1411 aa37.31■■■■□ 3.56
HAR1A-201ENST00000433161 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.31■■■■□ 3.56
HAR1A-201ENST00000433161 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
HAR1A-201ENST00000433161 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
HAR1A-201ENST00000433161 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
HAR1A-201ENST00000433161 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
HAR1A-201ENST00000433161 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.22■■■■□ 3.55
HAR1A-201ENST00000433161 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.21■■■■□ 3.55
HAR1A-201ENST00000433161 PBRM1Q86U86 1689 aa37.14■■■■□ 3.54
HAR1A-201ENST00000433161 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.12■■■■□ 3.53
HAR1A-201ENST00000433161 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.08■■■■□ 3.53
HAR1A-201ENST00000433161 IGF1RP08069 1367 aa37.08■■■■□ 3.53
HAR1A-201ENST00000433161 GRIN2BQ13224 1484 aa37.05■■■■□ 3.52
HAR1A-201ENST00000433161 CUL7Q14999 1698 aa36.97■■■■□ 3.51
HAR1A-201ENST00000433161 PRXQ9BXM0 1461 aa36.91■■■■□ 3.5
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HAR1A-201ENST00000433161 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.89■■■■□ 3.5
HAR1A-201ENST00000433161 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.89■■■■□ 3.5
HAR1A-201ENST00000433161 ADAMTS12P58397 1594 aa36.87■■■■□ 3.49
HAR1A-201ENST00000433161 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
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HAR1A-201ENST00000433161 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.79■■■■□ 3.48
HAR1A-201ENST00000433161 GOLGA3Q08378 1498 aa36.74■■■■□ 3.47
HAR1A-201ENST00000433161 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.74■■■■□ 3.47
HAR1A-201ENST00000433161 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.71■■■■□ 3.47
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HAR1A-201ENST00000433161 GRIN2AQ12879 1464 aa36.61■■■■□ 3.45
HAR1A-201ENST00000433161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
HAR1A-201ENST00000433161 CHD1O14646 1710 aa36.59■■■■□ 3.45
HAR1A-201ENST00000433161 FBLN2P98095 1184 aa36.56■■■■□ 3.44
HAR1A-201ENST00000433161 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
HAR1A-201ENST00000433161 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.47■■■■□ 3.43
HAR1A-201ENST00000433161 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.45■■■■□ 3.43
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