RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393810.5

SLC35B2-201, Transcript of solute carrier family 35 member B2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC35B2, Length 1,898 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B2-201ENST00000393810 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.53■■■■■ 5.84
SLC35B2-201ENST00000393810 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.45■■■■■ 4.87
SLC35B2-201ENST00000393810 ABCC9O60706 1549 aa43.82■■■■■ 4.61
SLC35B2-201ENST00000393810 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
SLC35B2-201ENST00000393810 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.91■■■■■ 4.46
SLC35B2-201ENST00000393810 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.63■■■■■ 4.41
SLC35B2-201ENST00000393810 NACADO15069 1562 aa42.56■■■■■ 4.4
SLC35B2-201ENST00000393810 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.51■■■■■ 4.4
SLC35B2-201ENST00000393810 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.45■■■■■ 4.39
SLC35B2-201ENST00000393810 SCRIBQ14160 1630 aa41.61■■■■■ 4.25
SLC35B2-201ENST00000393810 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.47■■■■■ 4.23
SLC35B2-201ENST00000393810 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.46■■■■■ 4.23
SLC35B2-201ENST00000393810 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
SLC35B2-201ENST00000393810 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.09■■■■■ 4.17
SLC35B2-201ENST00000393810 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
SLC35B2-201ENST00000393810 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.07■■■■■ 4.01
SLC35B2-201ENST00000393810 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
SLC35B2-201ENST00000393810 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
SLC35B2-201ENST00000393810 SMARCA4P51532 1647 aa39.83■■■■□ 3.97
SLC35B2-201ENST00000393810 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC35B2-201ENST00000393810 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.64■■■■□ 3.94
SLC35B2-201ENST00000393810 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
SLC35B2-201ENST00000393810 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.47■■■■□ 3.91
SLC35B2-201ENST00000393810 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.42■■■■□ 3.9
SLC35B2-201ENST00000393810 SMARCA2P51531 1590 aa39.41■■■■□ 3.9
SLC35B2-201ENST00000393810 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.38■■■■□ 3.89
SLC35B2-201ENST00000393810 WIZO95785 1651 aa39.36■■■■□ 3.89
SLC35B2-201ENST00000393810 NCAPD3P42695 1498 aa39.25■■■■□ 3.87
SLC35B2-201ENST00000393810 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
SLC35B2-201ENST00000393810 HMGXB3Q12766 1538 aa39.14■■■■□ 3.86
SLC35B2-201ENST00000393810 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
SLC35B2-201ENST00000393810 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.53■■■■□ 3.76
SLC35B2-201ENST00000393810 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.45■■■■□ 3.75
SLC35B2-201ENST00000393810 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.19■■■■□ 3.7
SLC35B2-201ENST00000393810 NESP48681 1621 aa38.13■■■■□ 3.69
SLC35B2-201ENST00000393810 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.12■■■■□ 3.69
SLC35B2-201ENST00000393810 CFTRP13569 1480 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC35B2-201ENST00000393810 PRDM2Q13029 1718 aa37.88■■■■□ 3.65
SLC35B2-201ENST00000393810 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.87■■■■□ 3.65
SLC35B2-201ENST00000393810 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC35B2-201ENST00000393810 ERCC6Q03468 1493 aa37.74■■■■□ 3.63
SLC35B2-201ENST00000393810 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC35B2-201ENST00000393810 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.66■■■■□ 3.62
SLC35B2-201ENST00000393810 TRIM41Q8WV44 630 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC35B2-201ENST00000393810 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.43■■■■□ 3.58
SLC35B2-201ENST00000393810 ABCC8Q09428 1581 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC35B2-201ENST00000393810 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
SLC35B2-201ENST00000393810 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.32■■■■□ 3.56
SLC35B2-201ENST00000393810 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.31■■■■□ 3.56
SLC35B2-201ENST00000393810 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.26■■■■□ 3.55
SLC35B2-201ENST00000393810 WDR62O43379 1518 aa37.24■■■■□ 3.55
SLC35B2-201ENST00000393810 TOPBP1Q92547 1522 aa37.24■■■■□ 3.55
SLC35B2-201ENST00000393810 CUX1P39880 1505 aa37.23■■■■□ 3.55
SLC35B2-201ENST00000393810 SYNJ1O43426 1573 aa37.16■■■■□ 3.54
SLC35B2-201ENST00000393810 TOP2BQ02880 1626 aa37.12■■■■□ 3.53
SLC35B2-201ENST00000393810 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.1■■■■□ 3.53
SLC35B2-201ENST00000393810 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.09■■■■□ 3.53
SLC35B2-201ENST00000393810 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
SLC35B2-201ENST00000393810 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.01■■■■□ 3.51
SLC35B2-201ENST00000393810 CUX2O14529 1486 aa36.98■■■■□ 3.51
SLC35B2-201ENST00000393810 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
SLC35B2-201ENST00000393810 SOGA1O94964 1423 aa36.86■■■■□ 3.49
SLC35B2-201ENST00000393810 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.82■■■■□ 3.48
SLC35B2-201ENST00000393810 IFT140Q96RY7 1462 aa36.81■■■■□ 3.48
SLC35B2-201ENST00000393810 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SLC35B2-201ENST00000393810 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.66■■■■□ 3.46
SLC35B2-201ENST00000393810 WDR97A6NE52 1622 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC35B2-201ENST00000393810 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
SLC35B2-201ENST00000393810 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
SLC35B2-201ENST00000393810 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.57■■■■□ 3.44
SLC35B2-201ENST00000393810 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.431e-6■■■■■ 40.2
SLC35B2-201ENST00000393810 KIF27Q86VH2 1401 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC35B2-201ENST00000393810 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
SLC35B2-201ENST00000393810 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC35B2-201ENST00000393810 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC35B2-201ENST00000393810 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC35B2-201ENST00000393810 EEA1Q15075 1411 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC35B2-201ENST00000393810 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.33■■■■□ 3.41
SLC35B2-201ENST00000393810 GRIN2BQ13224 1484 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC35B2-201ENST00000393810 PBRM1Q86U86 1689 aa36.3■■■■□ 3.4
SLC35B2-201ENST00000393810 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC35B2-201ENST00000393810 IGF1RP08069 1367 aa36.21■■■■□ 3.39
SLC35B2-201ENST00000393810 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC35B2-201ENST00000393810 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
SLC35B2-201ENST00000393810 CUL7Q14999 1698 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC35B2-201ENST00000393810 ADAMTS12P58397 1594 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC35B2-201ENST00000393810 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC35B2-201ENST00000393810 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC35B2-201ENST00000393810 FBLN2P98095 1184 aa36■■■■□ 3.35
SLC35B2-201ENST00000393810 SYNJ2O15056 1496 aa35.99■■■■□ 3.35
SLC35B2-201ENST00000393810 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
SLC35B2-201ENST00000393810 GOLGA3Q08378 1498 aa35.98■■■■□ 3.35
SLC35B2-201ENST00000393810 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SLC35B2-201ENST00000393810 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC35B2-201ENST00000393810 PRXQ9BXM0 1461 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC35B2-201ENST00000393810 KIF21BO75037 1637 aa35.91■■■■□ 3.34
SLC35B2-201ENST00000393810 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.91■■■■□ 3.34
SLC35B2-201ENST00000393810 CHD1O14646 1710 aa35.87■■■■□ 3.33
SLC35B2-201ENST00000393810 GRIN2AQ12879 1464 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC35B2-201ENST00000393810 CEP162Q5TB80 1403 aa35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms