Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TGOLN2O43493 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGOLN2O43493 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms