RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.39■■■■■ 5.18
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C6orf136-201ENST00000293604 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.85■■■■□ 3.81
C6orf136-201ENST00000293604 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.6■■■■□ 3.77
C6orf136-201ENST00000293604 ABCC9O60706 1549 aa38.3■■■■□ 3.72
C6orf136-201ENST00000293604 NACADO15069 1562 aa38.17■■■■□ 3.7
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C6orf136-201ENST00000293604 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.7■■■■□ 3.63
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C6orf136-201ENST00000293604 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.72■■■■□ 3.47
C6orf136-201ENST00000293604 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.6■■■■□ 3.45
C6orf136-201ENST00000293604 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
C6orf136-201ENST00000293604 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.52■■■■□ 3.44
C6orf136-201ENST00000293604 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.44■■■■□ 3.42
C6orf136-201ENST00000293604 WIZO95785 1651 aa36.33■■■■□ 3.41
C6orf136-201ENST00000293604 SMARCA4P51532 1647 aa36.32■■■■□ 3.41
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C6orf136-201ENST00000293604 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.9■■■■□ 3.34
C6orf136-201ENST00000293604 HRCP23327 699 aa35.69■■■■□ 3.3
C6orf136-201ENST00000293604 SMARCA2P51531 1590 aa35.68■■■■□ 3.3
C6orf136-201ENST00000293604 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.62■■■■□ 3.29
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C6orf136-201ENST00000293604 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.57■■■■□ 3.29
C6orf136-201ENST00000293604 TRIM41Q8WV44 630 aa35.49■■■■□ 3.27
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C6orf136-201ENST00000293604 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.29■■■■□ 3.24
C6orf136-201ENST00000293604 HMGXB3Q12766 1538 aa35.23■■■■□ 3.23
C6orf136-201ENST00000293604 NCAPD3P42695 1498 aa35.2■■■■□ 3.23
C6orf136-201ENST00000293604 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.1■■■■□ 3.21
C6orf136-201ENST00000293604 ABCC8Q09428 1581 aa35.02■■■■□ 3.2
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C6orf136-201ENST00000293604 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
C6orf136-201ENST00000293604 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.72■■■■□ 3.15
C6orf136-201ENST00000293604 EEA1Q15075 1411 aa34.63■■■■□ 3.13
C6orf136-201ENST00000293604 SYNJ1O43426 1573 aa34.6■■■■□ 3.13
C6orf136-201ENST00000293604 CFTRP13569 1480 aa34.57■■■■□ 3.12
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C6orf136-201ENST00000293604 SOGA1O94964 1423 aa34.47■■■■□ 3.11
C6orf136-201ENST00000293604 PRDM2Q13029 1718 aa34.47■■■■□ 3.11
C6orf136-201ENST00000293604 TOP2BQ02880 1626 aa34.46■■■■□ 3.11
C6orf136-201ENST00000293604 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.42■■■■□ 3.1
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C6orf136-201ENST00000293604 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.31■■■■□ 3.08
C6orf136-201ENST00000293604 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.29■■■■□ 3.08
C6orf136-201ENST00000293604 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.22■■■■□ 3.07
C6orf136-201ENST00000293604 CUX1P39880 1505 aa34.2■■■■□ 3.07
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C6orf136-201ENST00000293604 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.12■■■■□ 3.05
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C6orf136-201ENST00000293604 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.94■■■■□ 3.02
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C6orf136-201ENST00000293604 NESP48681 1621 aa33.79■■■■□ 3
C6orf136-201ENST00000293604 PRXQ9BXM0 1461 aa33.77■■■■□ 3
C6orf136-201ENST00000293604 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.77■■■■□ 3
C6orf136-201ENST00000293604 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.77■■■■□ 3
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C6orf136-201ENST00000293604 CUX2O14529 1486 aa33.62■■■□□ 2.97
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C6orf136-201ENST00000293604 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.44■■■□□ 2.94
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C6orf136-201ENST00000293604 WDR97A6NE52 1622 aa33.34■■■□□ 2.93
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C6orf136-201ENST00000293604 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.07■■■□□ 2.88
C6orf136-201ENST00000293604 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.06■■■□□ 2.88
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C6orf136-201ENST00000293604 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
C6orf136-201ENST00000293604 WDR62O43379 1518 aa32.98■■■□□ 2.87
C6orf136-201ENST00000293604 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.94■■■□□ 2.86
C6orf136-201ENST00000293604 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
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C6orf136-201ENST00000293604 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.85■■■□□ 2.85
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