RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.39■■■■■ 5.18
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C6orf136-201ENST00000293604 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.85■■■■□ 3.81
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C6orf136-201ENST00000293604 HRCP23327 699 aa35.69■■■■□ 3.3
C6orf136-201ENST00000293604 SMARCA2P51531 1590 aa35.68■■■■□ 3.3
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C6orf136-201ENST00000293604 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.1■■■■□ 3.21
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C6orf136-201ENST00000293604 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
C6orf136-201ENST00000293604 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.72■■■■□ 3.15
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C6orf136-201ENST00000293604 SYNJ1O43426 1573 aa34.6■■■■□ 3.13
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C6orf136-201ENST00000293604 SOGA1O94964 1423 aa34.47■■■■□ 3.11
C6orf136-201ENST00000293604 PRDM2Q13029 1718 aa34.47■■■■□ 3.11
C6orf136-201ENST00000293604 TOP2BQ02880 1626 aa34.46■■■■□ 3.11
C6orf136-201ENST00000293604 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.42■■■■□ 3.1
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C6orf136-201ENST00000293604 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.94■■■■□ 3.02
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C6orf136-201ENST00000293604 PRXQ9BXM0 1461 aa33.77■■■■□ 3
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C6orf136-201ENST00000293604 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.44■■■□□ 2.94
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C6orf136-201ENST00000293604 WDR97A6NE52 1622 aa33.34■■■□□ 2.93
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C6orf136-201ENST00000293604 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
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C6orf136-201ENST00000293604 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.07■■■□□ 2.88
C6orf136-201ENST00000293604 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.06■■■□□ 2.88
C6orf136-201ENST00000293604 APLP2Q06481 763 aa33.05■■■□□ 2.88
C6orf136-201ENST00000293604 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
C6orf136-201ENST00000293604 WDR62O43379 1518 aa32.98■■■□□ 2.87
C6orf136-201ENST00000293604 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.94■■■□□ 2.86
C6orf136-201ENST00000293604 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.91■■■□□ 2.86
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C6orf136-201ENST00000293604 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.85■■■□□ 2.85
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