Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITIH3Q06033 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITIH3Q06033 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITIH3Q06033 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms