Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ITIH3Q06033 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ITIH3Q06033 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ITIH3Q06033 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ITIH3Q06033 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITIH3Q06033 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ITIH3Q06033 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ITIH3Q06033 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ITIH3Q06033 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ITIH3Q06033 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITIH3Q06033 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ITIH3Q06033 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ITIH3Q06033 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ITIH3Q06033 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ITIH3Q06033 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ITIH3Q06033 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ITIH3Q06033 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ITIH3Q06033 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ITIH3Q06033 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITIH3Q06033 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITIH3Q06033 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITIH3Q06033 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITIH3Q06033 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITIH3Q06033 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITIH3Q06033 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITIH3Q06033 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITIH3Q06033 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITIH3Q06033 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITIH3Q06033 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITIH3Q06033 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITIH3Q06033 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ITIH3Q06033 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITIH3Q06033 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ITIH3Q06033 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITIH3Q06033 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITIH3Q06033 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITIH3Q06033 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITIH3Q06033 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITIH3Q06033 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITIH3Q06033 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITIH3Q06033 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITIH3Q06033 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITIH3Q06033 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITIH3Q06033 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITIH3Q06033 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITIH3Q06033 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ITIH3Q06033 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ITIH3Q06033 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITIH3Q06033 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITIH3Q06033 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITIH3Q06033 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITIH3Q06033 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
ITIH3Q06033 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ITIH3Q06033 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ITIH3Q06033 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ITIH3Q06033 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ITIH3Q06033 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ITIH3Q06033 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ITIH3Q06033 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ITIH3Q06033 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ITIH3Q06033 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ITIH3Q06033 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ITIH3Q06033 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ITIH3Q06033 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITIH3Q06033 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ITIH3Q06033 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ITIH3Q06033 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ITIH3Q06033 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ITIH3Q06033 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ITIH3Q06033 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ITIH3Q06033 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITIH3Q06033 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ITIH3Q06033 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
ITIH3Q06033 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ITIH3Q06033 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ITIH3Q06033 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITIH3Q06033 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ITIH3Q06033 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ITIH3Q06033 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ITIH3Q06033 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ITIH3Q06033 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ITIH3Q06033 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ITIH3Q06033 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITIH3Q06033 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ITIH3Q06033 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ITIH3Q06033 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ITIH3Q06033 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ITIH3Q06033 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ITIH3Q06033 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ITIH3Q06033 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ITIH3Q06033 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITIH3Q06033 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ITIH3Q06033 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ITIH3Q06033 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms