RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236040.8

P3H1-201, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene P3H1, Length 2,993 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-201ENST00000236040 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.66■■■□□ 2.66
P3H1-201ENST00000236040 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.63■■■□□ 2.01
P3H1-201ENST00000236040 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
P3H1-201ENST00000236040 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.91■■□□□ 1.9
P3H1-201ENST00000236040 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
P3H1-201ENST00000236040 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.63■■□□□ 1.85
P3H1-201ENST00000236040 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.16■■□□□ 1.78
P3H1-201ENST00000236040 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.1■■□□□ 1.77
P3H1-201ENST00000236040 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.69■■□□□ 1.7
P3H1-201ENST00000236040 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.64■■□□□ 1.69
P3H1-201ENST00000236040 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.63■■□□□ 1.69
P3H1-201ENST00000236040 HRCP23327 699 aa25.43■■□□□ 1.66
P3H1-201ENST00000236040 SCRIBQ14160 1630 aa25.4■■□□□ 1.66
P3H1-201ENST00000236040 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
P3H1-201ENST00000236040 ABCC9O60706 1549 aa25.22■■□□□ 1.63
P3H1-201ENST00000236040 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
P3H1-201ENST00000236040 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.17■■□□□ 1.62
P3H1-201ENST00000236040 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
P3H1-201ENST00000236040 TRIM41Q8WV44 630 aa25.07■■□□□ 1.6
P3H1-201ENST00000236040 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.99■■□□□ 1.59
P3H1-201ENST00000236040 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.92■■□□□ 1.58
P3H1-201ENST00000236040 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
P3H1-201ENST00000236040 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-201ENST00000236040 NACADO15069 1562 aa24.7■■□□□ 1.54
P3H1-201ENST00000236040 WIZO95785 1651 aa24.65■■□□□ 1.54
P3H1-201ENST00000236040 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
P3H1-201ENST00000236040 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
P3H1-201ENST00000236040 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
P3H1-201ENST00000236040 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.482e-6■□□□□ 11
P3H1-201ENST00000236040 ABCC8Q09428 1581 aa24.23■■□□□ 1.47
P3H1-201ENST00000236040 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
P3H1-201ENST00000236040 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.14■■□□□ 1.45
P3H1-201ENST00000236040 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
P3H1-201ENST00000236040 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
P3H1-201ENST00000236040 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.09■■□□□ 1.45
P3H1-201ENST00000236040 SMARCA4P51532 1647 aa24.09■■□□□ 1.45
P3H1-201ENST00000236040 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
P3H1-201ENST00000236040 SOGA1O94964 1423 aa24.02■■□□□ 1.44
P3H1-201ENST00000236040 SMARCA2P51531 1590 aa24.01■■□□□ 1.43
P3H1-201ENST00000236040 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
P3H1-201ENST00000236040 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
P3H1-201ENST00000236040 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.95■■□□□ 1.42
P3H1-201ENST00000236040 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
P3H1-201ENST00000236040 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.85■■□□□ 1.41
P3H1-201ENST00000236040 CEP162Q5TB80 1403 aa23.84■■□□□ 1.41
P3H1-201ENST00000236040 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.77■■□□□ 1.4
P3H1-201ENST00000236040 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
P3H1-201ENST00000236040 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.69■■□□□ 1.38
P3H1-201ENST00000236040 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
P3H1-201ENST00000236040 SYNJ1O43426 1573 aa23.55■■□□□ 1.36
P3H1-201ENST00000236040 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
P3H1-201ENST00000236040 GOLGA3Q08378 1498 aa23.55■■□□□ 1.36
P3H1-201ENST00000236040 EEA1Q15075 1411 aa23.53■■□□□ 1.36
P3H1-201ENST00000236040 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.51■■□□□ 1.35
P3H1-201ENST00000236040 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
P3H1-201ENST00000236040 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
P3H1-201ENST00000236040 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.43■■□□□ 1.34
P3H1-201ENST00000236040 CLIP1P30622 1438 aa23.39■■□□□ 1.34
P3H1-201ENST00000236040 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.38■■□□□ 1.33
P3H1-201ENST00000236040 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.37■■□□□ 1.33
P3H1-201ENST00000236040 MYT1Q01538 1121 aa23.36■■□□□ 1.33
P3H1-201ENST00000236040 NEUROD1Q13562 356 aa23.36■■□□□ 1.33
P3H1-201ENST00000236040 APLP2Q06481 763 aa23.33■■□□□ 1.33
P3H1-201ENST00000236040 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
P3H1-201ENST00000236040 KIF21BO75037 1637 aa23.25■■□□□ 1.31
P3H1-201ENST00000236040 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
P3H1-201ENST00000236040 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.21■■□□□ 1.31
P3H1-201ENST00000236040 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
P3H1-201ENST00000236040 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.16■■□□□ 1.3
P3H1-201ENST00000236040 TOP2BQ02880 1626 aa23.11■■□□□ 1.29
P3H1-201ENST00000236040 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
P3H1-201ENST00000236040 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
P3H1-201ENST00000236040 MIER1Q8N108 512 aa23.03■■□□□ 1.28
P3H1-201ENST00000236040 ITGAEP38570 1179 aa23■■□□□ 1.27
P3H1-201ENST00000236040 CUX1P39880 1505 aa23■■□□□ 1.27
P3H1-201ENST00000236040 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.96■■□□□ 1.27
P3H1-201ENST00000236040 PRXQ9BXM0 1461 aa22.95■■□□□ 1.27
P3H1-201ENST00000236040 ARAP1Q96P48 1450 aa22.95■■□□□ 1.26
P3H1-201ENST00000236040 NCAPD3P42695 1498 aa22.94■■□□□ 1.26
P3H1-201ENST00000236040 KIF27Q86VH2 1401 aa22.89■■□□□ 1.26
P3H1-201ENST00000236040 HMGXB3Q12766 1538 aa22.84■■□□□ 1.25
P3H1-201ENST00000236040 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.84■■□□□ 1.25
P3H1-201ENST00000236040 CFTRP13569 1480 aa22.82■■□□□ 1.24
P3H1-201ENST00000236040 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
P3H1-201ENST00000236040 P3H3Q8IVL6 736 aa22.8■■□□□ 1.24
P3H1-201ENST00000236040 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
P3H1-201ENST00000236040 CUX2O14529 1486 aa22.76■■□□□ 1.23
P3H1-201ENST00000236040 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.76■■□□□ 1.23
P3H1-201ENST00000236040 IGF1RP08069 1367 aa22.71■■□□□ 1.23
P3H1-201ENST00000236040 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.66■■□□□ 1.22
P3H1-201ENST00000236040 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.63■■□□□ 1.21
P3H1-201ENST00000236040 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.63■■□□□ 1.21
P3H1-201ENST00000236040 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
P3H1-201ENST00000236040 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.61■■□□□ 1.21
P3H1-201ENST00000236040 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
P3H1-201ENST00000236040 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.54■■□□□ 1.2
P3H1-201ENST00000236040 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.53■■□□□ 1.2
P3H1-201ENST00000236040 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.51■■□□□ 1.19
P3H1-201ENST00000236040 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.49■■□□□ 1.19
P3H1-201ENST00000236040 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.48■■□□□ 1.19
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