Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-20■■■□□ 16
PCBP2Q15366 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-20■■■□□ 16
PCBP2Q15366 DDX39B-207ENST00000427214 1005 ntTSL 56.21□□□□□ -1.421e-20■■■□□ 16
PCBP2Q15366 NUDCD3-201ENST00000338427 779 ntTSL 312.36□□□□□ -0.432e-12■■■□□ 16
PCBP2Q15366 NUDCD3-206ENST00000475952 983 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-12■■■□□ 16
PCBP2Q15366 NUDCD3-210ENST00000493613 613 ntTSL 39.41□□□□□ -0.92e-12■■■□□ 16
PCBP2Q15366 NUDCD3-209ENST00000487118 314 ntTSL 38.44□□□□□ -1.062e-12■■■□□ 16
PCBP2Q15366 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.518e-8■■■□□ 16
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PCBP2Q15366 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.14e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 UBE2Z-202ENST00000504684 598 ntTSL 47.82□□□□□ -1.162e-9■■■□□ 16
PCBP2Q15366 UBE2Z-206ENST00000511373 769 ntTSL 25.01□□□□□ -1.612e-9■■■□□ 16
PCBP2Q15366 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 SLC39A14-209ENST00000520644 377 ntTSL 518.59■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 SLC39A14-212ENST00000524285 570 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 ATXN1-206ENST00000483591 892 ntTSL 1 (best)8.57□□□□□ -1.045e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.489e-10■■■□□ 16
PCBP2Q15366 GRINA-209ENST00000533377 627 ntTSL 214.45□□□□□ -0.14e-36■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 322.4■■□□□ 1.186e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 419.39■□□□□ 0.696e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 418.31■□□□□ 0.526e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.166e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.136e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 214.13□□□□□ -0.156e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 213.76□□□□□ -0.216e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.346e-13■■■□□ 16
PCBP2Q15366 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 RFX3-210ENST00000457373 822 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 RFX3-209ENST00000451859 740 ntTSL 38.04□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 PVT1-210ENST00000521122 221 ntTSL 38.61□□□□□ -1.033e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 TRIM41-206ENST00000514219 459 ntTSL 515.5■□□□□ 0.071e-11■■■□□ 16
PCBP2Q15366 TRIM41-209ENST00000515834 7015 ntTSL 1 (best)10.9□□□□□ -0.671e-11■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MPRIP-211ENST00000578209 751 ntTSL 37.13□□□□□ -1.272e-7■■■□□ 16
PCBP2Q15366 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.172e-9■■■□□ 16
PCBP2Q15366 AAMP-210ENST00000494720 1134 ntTSL 220.05■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 AAMP-207ENST00000465442 1016 ntTSL 219.18■□□□□ 0.661e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 AAMP-203ENST00000422731 742 ntTSL 312.43□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 16
PCBP2Q15366 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 25.39□□□□□ -1.551e-6■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 DLEU1-216ENST00000473075 348 ntTSL 53.93□□□□□ -1.782e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.015e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.495e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.945e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.43e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.793e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 DUSP16-205ENST00000541207 585 ntTSL 47.71□□□□□ -1.183e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 DUSP16-203ENST00000536236 258 ntTSL 37.32□□□□□ -1.243e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 DUSP16-204ENST00000539940 566 ntTSL 45.46□□□□□ -1.543e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 HUWE1-210ENST00000474971 598 ntTSL 24.22□□□□□ -1.733e-10■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 TRIM47-204ENST00000587339 1907 ntTSL 1 (best)19.49■□□□□ 0.716e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.556e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 TRIM47-202ENST00000585333 595 ntTSL 312.57□□□□□ -0.46e-9■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 MORC3-205ENST00000487909 4131 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-6■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.391e-10■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ARCN1-205ENST00000614498 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.291e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.411e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.515e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-14■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CAMTA2-210ENST00000574442 764 ntTSL 213.22□□□□□ -0.293e-13■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.619e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.36e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.018e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.026e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.19■□□□□ 0.664e-7■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.614e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.284e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 421.46■■□□□ 1.034e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 321.46■■□□□ 1.034e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.024e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 220.42■□□□□ 0.864e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 FAM213B-203ENST00000378427 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.8■□□□□ 0.764e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 FAM213B-212ENST00000484099 2577 ntTSL 219.4■□□□□ 0.74e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.644e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 HP1BP3-210ENST00000438032 1159 ntTSL 518.69■□□□□ 0.584e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CD27-AS1-208ENST00000538616 657 ntTSL 218.01■□□□□ 0.474e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.464e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.464e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 CANX-213ENST00000507307 582 ntTSL 517.81■□□□□ 0.444e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-8■■■□□ 15.9
PCBP2Q15366 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.434e-8■■■□□ 15.9
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