RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.12■■■■■ 5.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCC9O60706 1549 aa44.24■■■■■ 4.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.48■■■■■ 4.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.22■■■■■ 4.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.83■■■■■ 4.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 NACADO15069 1562 aa41.37■■■■■ 4.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.02■■■■■ 4.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.7■■■■■ 4.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.59■■■■■ 4.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.55■■■■■ 4.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.09■■■■■ 4.01
CD27-AS1-208ENST00000538616 CECR2Q9BXF3 1484 aa40■■■■□ 3.99
CD27-AS1-208ENST00000538616 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.91■■■■□ 3.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.75■■■■□ 3.95
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCRIBQ14160 1630 aa39.51■■■■□ 3.92
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.47■■■■□ 3.91
CD27-AS1-208ENST00000538616 CUX2O14529 1486 aa38.55■■■■□ 3.76
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERCC6Q03468 1493 aa38.34■■■■□ 3.73
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCAPD3P42695 1498 aa38.23■■■■□ 3.71
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.95■■■■□ 3.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMARCA2P51531 1590 aa37.83■■■■□ 3.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 HMGXB3Q12766 1538 aa37.82■■■■□ 3.65
CD27-AS1-208ENST00000538616 NESP48681 1621 aa37.76■■■■□ 3.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMARCA4P51532 1647 aa37.65■■■■□ 3.62
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
CD27-AS1-208ENST00000538616 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.46■■■■□ 3.59
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.34■■■■□ 3.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM41Q8WV44 630 aa37.34■■■■□ 3.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.34■■■■□ 3.57
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.18■■■■□ 3.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.04■■■■□ 3.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.01■■■■□ 3.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.98■■■■□ 3.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR62O43379 1518 aa36.89■■■■□ 3.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 OSCARQ8IYS5 282 aa36.74■■■■□ 3.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.69■■■■□ 3.46
CD27-AS1-208ENST00000538616 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.56■■■■□ 3.44
CD27-AS1-208ENST00000538616 WIZO95785 1651 aa36.49■■■■□ 3.43
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFTRP13569 1480 aa36.42■■■■□ 3.42
CD27-AS1-208ENST00000538616 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
CD27-AS1-208ENST00000538616 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.16■■■■□ 3.38
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF11O15085 1522 aa36.02■■■■□ 3.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFT140Q96RY7 1462 aa36.01■■■■□ 3.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.87■■■■□ 3.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRDM2Q13029 1718 aa35.85■■■■□ 3.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 TOPBP1Q92547 1522 aa35.77■■■■□ 3.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCC8Q09428 1581 aa35.75■■■■□ 3.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.66■■■■□ 3.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARAP1Q96P48 1450 aa35.59■■■■□ 3.29
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.55■■■■□ 3.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBLN2P98095 1184 aa35.55■■■■□ 3.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHD1O14646 1710 aa35.52■■■■□ 3.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CD27-AS1-208ENST00000538616 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 SOGA1O94964 1423 aa35.23■■■■□ 3.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.21■■■■□ 3.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.16■■■■□ 3.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.16■■■■□ 3.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR97A6NE52 1622 aa35.14■■■■□ 3.22
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYNJ1O43426 1573 aa35.13■■■■□ 3.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRIN2BQ13224 1484 aa35.01■■■■□ 3.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35■■■■□ 3.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYNJ2O15056 1496 aa34.98■■■■□ 3.19
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.9■■■■□ 3.18
CD27-AS1-208ENST00000538616 CUX1P39880 1505 aa34.82■■■■□ 3.16
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
CD27-AS1-208ENST00000538616 PBRM1Q86U86 1689 aa34.67■■■■□ 3.14
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.6■■■■□ 3.13
CD27-AS1-208ENST00000538616 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.55■■■■□ 3.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 GRIN2AQ12879 1464 aa34.52■■■■□ 3.12
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.49■■■■□ 3.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUP160Q12769 1436 aa34.45■■■■□ 3.11
CD27-AS1-208ENST00000538616 CEP170Q5SW79 1584 aa34.45■■■■□ 3.1
CD27-AS1-208ENST00000538616 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADAMTS12P58397 1594 aa34.34■■■■□ 3.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHROOM2Q13796 1616 aa34.33■■■■□ 3.09
CD27-AS1-208ENST00000538616 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.32■■■■□ 3.08
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.25■■■■□ 3.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 JPH4Q96JJ6 628 aa34.17■■■■□ 3.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.16■■■■□ 3.06
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.16■■■■□ 3.06
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