RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398125.5

ADD1-205, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ADD1, Length 4,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-205ENST00000398125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.55■■■□□ 2.64
ADD1-205ENST00000398125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.46■■■□□ 2.15
ADD1-205ENST00000398125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
ADD1-205ENST00000398125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.02■■■□□ 2.08
ADD1-205ENST00000398125 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.44■■□□□ 1.98
ADD1-205ENST00000398125 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
ADD1-205ENST00000398125 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27■■□□□ 1.91
ADD1-205ENST00000398125 HRCP23327 699 aa26.98■■□□□ 1.91
ADD1-205ENST00000398125 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.83■■□□□ 1.89
ADD1-205ENST00000398125 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.76■■□□□ 1.88
ADD1-205ENST00000398125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ADD1-205ENST00000398125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.62■■□□□ 1.85
ADD1-205ENST00000398125 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
ADD1-205ENST00000398125 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.37■■□□□ 1.81
ADD1-205ENST00000398125 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ADD1-205ENST00000398125 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ADD1-205ENST00000398125 TRIM41Q8WV44 630 aa25.97■■□□□ 1.75
ADD1-205ENST00000398125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.71■■□□□ 1.71
ADD1-205ENST00000398125 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
ADD1-205ENST00000398125 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
ADD1-205ENST00000398125 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ADD1-205ENST00000398125 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
ADD1-205ENST00000398125 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
ADD1-205ENST00000398125 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ADD1-205ENST00000398125 ABCC9O60706 1549 aa25.26■■□□□ 1.63
ADD1-205ENST00000398125 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ADD1-205ENST00000398125 SCRIBQ14160 1630 aa25.21■■□□□ 1.63
ADD1-205ENST00000398125 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ADD1-205ENST00000398125 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.12■■□□□ 1.61
ADD1-205ENST00000398125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ADD1-205ENST00000398125 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ADD1-205ENST00000398125 NEUROD1Q13562 356 aa25.06■■□□□ 1.6
ADD1-205ENST00000398125 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ADD1-205ENST00000398125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25■■□□□ 1.59
ADD1-205ENST00000398125 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ADD1-205ENST00000398125 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ADD1-205ENST00000398125 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.86■■□□□ 1.57
ADD1-205ENST00000398125 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.72■■□□□ 1.55
ADD1-205ENST00000398125 APLP2Q06481 763 aa24.68■■□□□ 1.54
ADD1-205ENST00000398125 WIZO95785 1651 aa24.65■■□□□ 1.54
ADD1-205ENST00000398125 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ADD1-205ENST00000398125 NACADO15069 1562 aa24.49■■□□□ 1.51
ADD1-205ENST00000398125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
ADD1-205ENST00000398125 MIER1Q8N108 512 aa24.42■■□□□ 1.5
ADD1-205ENST00000398125 ITGAEP38570 1179 aa24.4■■□□□ 1.5
ADD1-205ENST00000398125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.33■■□□□ 1.48
ADD1-205ENST00000398125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ADD1-205ENST00000398125 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.25■■□□□ 1.47
ADD1-205ENST00000398125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
ADD1-205ENST00000398125 BCANQ96GW7 911 aa24.17■■□□□ 1.46
ADD1-205ENST00000398125 ABCC8Q09428 1581 aa24.15■■□□□ 1.46
ADD1-205ENST00000398125 MYT1Q01538 1121 aa24.11■■□□□ 1.45
ADD1-205ENST00000398125 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
ADD1-205ENST00000398125 CEP162Q5TB80 1403 aa24.07■■□□□ 1.44
ADD1-205ENST00000398125 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.05■■□□□ 1.44
ADD1-205ENST00000398125 SMARCA4P51532 1647 aa24.03■■□□□ 1.44
ADD1-205ENST00000398125 SOGA1O94964 1423 aa24.02■■□□□ 1.44
ADD1-205ENST00000398125 SMARCA2P51531 1590 aa24.01■■□□□ 1.43
ADD1-205ENST00000398125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
ADD1-205ENST00000398125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.93■■□□□ 1.42
ADD1-205ENST00000398125 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.88■■□□□ 1.41
ADD1-205ENST00000398125 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ADD1-205ENST00000398125 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.74■■□□□ 1.39
ADD1-205ENST00000398125 NEFLP07196 543 aa23.7■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 CLIP1P30622 1438 aa23.66■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 FKBP8Q14318 412 aa23.64■■□□□ 1.38
ADD1-205ENST00000398125 KCNH8Q96L42 1107 aa23.62■■□□□ 1.37
ADD1-205ENST00000398125 TRIM52Q96A61 297 aa23.59■■□□□ 1.37
ADD1-205ENST00000398125 P3H3Q8IVL6 736 aa23.59■■□□□ 1.37
ADD1-205ENST00000398125 SYNJ1O43426 1573 aa23.57■■□□□ 1.36
ADD1-205ENST00000398125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
ADD1-205ENST00000398125 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.54■■□□□ 1.36
ADD1-205ENST00000398125 GOLGA3Q08378 1498 aa23.52■■□□□ 1.36
ADD1-205ENST00000398125 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ADD1-205ENST00000398125 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.48■■□□□ 1.35
ADD1-205ENST00000398125 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ADD1-205ENST00000398125 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.41■■□□□ 1.34
ADD1-205ENST00000398125 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.38■■□□□ 1.33
ADD1-205ENST00000398125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.34■■□□□ 1.33
ADD1-205ENST00000398125 EEA1Q15075 1411 aa23.31■■□□□ 1.32
ADD1-205ENST00000398125 ANP32CO43423 234 aa23.3■■□□□ 1.32
ADD1-205ENST00000398125 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.27■■□□□ 1.32
ADD1-205ENST00000398125 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.27■■□□□ 1.32
ADD1-205ENST00000398125 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.27■■□□□ 1.32
ADD1-205ENST00000398125 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.25■■□□□ 1.31
ADD1-205ENST00000398125 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.24■■□□□ 1.31
ADD1-205ENST00000398125 KIF21BO75037 1637 aa23.22■■□□□ 1.31
ADD1-205ENST00000398125 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ADD1-205ENST00000398125 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.19■■□□□ 1.3
ADD1-205ENST00000398125 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
ADD1-205ENST00000398125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
ADD1-205ENST00000398125 ARID3CA6NKF2 412 aa23.13■■□□□ 1.29
ADD1-205ENST00000398125 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.09■■□□□ 1.29
ADD1-205ENST00000398125 TOP2BQ02880 1626 aa23.08■■□□□ 1.29
ADD1-205ENST00000398125 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ADD1-205ENST00000398125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms