Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHMP4BP1P59074 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP4BP1P59074 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHMP4BP1P59074 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.2 ms