Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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NFKB1P19838 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NFKB1P19838 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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