RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282999.7

SRP19-201, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRP19, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SRP19-201ENST00000282999 SCRIBQ14160 1630 aa32.52■■■□□ 2.8
SRP19-201ENST00000282999 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.5■■■□□ 2.79
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SRP19-201ENST00000282999 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.89■■■□□ 2.7
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SRP19-201ENST00000282999 SMARCA2P51531 1590 aa31■■■□□ 2.55
SRP19-201ENST00000282999 HMGXB3Q12766 1538 aa30.92■■■□□ 2.54
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SRP19-201ENST00000282999 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.78■■■□□ 2.52
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SRP19-201ENST00000282999 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.34■■■□□ 2.45
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SRP19-201ENST00000282999 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.13■■■□□ 2.41
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SRP19-201ENST00000282999 CFTRP13569 1480 aa29.89■■■□□ 2.38
SRP19-201ENST00000282999 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.84■■■□□ 2.37
SRP19-201ENST00000282999 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.81■■■□□ 2.36
SRP19-201ENST00000282999 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.8■■■□□ 2.36
SRP19-201ENST00000282999 WDR62O43379 1518 aa29.76■■■□□ 2.36
SRP19-201ENST00000282999 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.74■■■□□ 2.35
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SRP19-201ENST00000282999 PRDM2Q13029 1718 aa29.64■■■□□ 2.34
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SRP19-201ENST00000282999 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.23■■■□□ 2.27
SRP19-201ENST00000282999 IFT140Q96RY7 1462 aa29.21■■■□□ 2.27
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SRP19-201ENST00000282999 CUX1P39880 1505 aa28.9■■■□□ 2.22
SRP19-201ENST00000282999 SOGA1O94964 1423 aa28.87■■■□□ 2.21
SRP19-201ENST00000282999 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.87■■■□□ 2.21
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SRP19-201ENST00000282999 WDR97A6NE52 1622 aa28.81■■■□□ 2.2
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SRP19-201ENST00000282999 CHD1O14646 1710 aa28.63■■■□□ 2.17
SRP19-201ENST00000282999 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
SRP19-201ENST00000282999 GRIN2BQ13224 1484 aa28.6■■■□□ 2.17
SRP19-201ENST00000282999 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.6■■■□□ 2.17
SRP19-201ENST00000282999 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.59■■■□□ 2.17
SRP19-201ENST00000282999 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.59■■■□□ 2.17
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SRP19-201ENST00000282999 TOP2BQ02880 1626 aa28.58■■■□□ 2.17
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SRP19-201ENST00000282999 PBRM1Q86U86 1689 aa28.5■■■□□ 2.15
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SRP19-201ENST00000282999 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
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SRP19-201ENST00000282999 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.22■■■□□ 2.11
SRP19-201ENST00000282999 ARAP1Q96P48 1450 aa28.21■■■□□ 2.11
SRP19-201ENST00000282999 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.18■■■□□ 2.1
SRP19-201ENST00000282999 NUP160Q12769 1436 aa28.12■■■□□ 2.09
SRP19-201ENST00000282999 CEP170Q5SW79 1584 aa28.08■■■□□ 2.09
SRP19-201ENST00000282999 KIF27Q86VH2 1401 aa28.05■■■□□ 2.08
SRP19-201ENST00000282999 SHROOM2Q13796 1616 aa27.95■■■□□ 2.06
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