RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTIF-201ENST00000256413 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.85■■□□□ 1.73
CTIF-201ENST00000256413 MYT1Q01538 1121 aa25.81■■□□□ 1.72
CTIF-201ENST00000256413 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CTIF-201ENST00000256413 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTIF-201ENST00000256413 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.2■■□□□ 1.62
CTIF-201ENST00000256413 ERICH6Q7L0X2 663 aa25■■□□□ 1.59
CTIF-201ENST00000256413 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CTIF-201ENST00000256413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.85■■□□□ 1.57
CTIF-201ENST00000256413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.83■■□□□ 1.56
CTIF-201ENST00000256413 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CTIF-201ENST00000256413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.56■■□□□ 1.52
CTIF-201ENST00000256413 HRCP23327 699 aa24.48■■□□□ 1.51
CTIF-201ENST00000256413 APLP2Q06481 763 aa24.4■■□□□ 1.5
CTIF-201ENST00000256413 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTIF-201ENST00000256413 NEFLP07196 543 aa24.27■■□□□ 1.48
CTIF-201ENST00000256413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CTIF-201ENST00000256413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CTIF-201ENST00000256413 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
CTIF-201ENST00000256413 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTIF-201ENST00000256413 TRIM41Q8WV44 630 aa23.72■■□□□ 1.39
CTIF-201ENST00000256413 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.52■■□□□ 1.36
CTIF-201ENST00000256413 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CTIF-201ENST00000256413 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTIF-201ENST00000256413 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTIF-201ENST00000256413 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CTIF-201ENST00000256413 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTIF-201ENST00000256413 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CTIF-201ENST00000256413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.2■■□□□ 1.31
CTIF-201ENST00000256413 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.15■■□□□ 1.3
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTIF-201ENST00000256413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CTIF-201ENST00000256413 BCANQ96GW7 911 aa23.03■■□□□ 1.28
CTIF-201ENST00000256413 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTIF-201ENST00000256413 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CTIF-201ENST00000256413 ITGAEP38570 1179 aa22.77■■□□□ 1.24
CTIF-201ENST00000256413 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.74■■□□□ 1.23
CTIF-201ENST00000256413 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CTIF-201ENST00000256413 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTIF-201ENST00000256413 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.69■■□□□ 1.22
CTIF-201ENST00000256413 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.66■■□□□ 1.22
CTIF-201ENST00000256413 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTIF-201ENST00000256413 NEUROD1Q13562 356 aa22.59■■□□□ 1.21
CTIF-201ENST00000256413 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.58■■□□□ 1.21
CTIF-201ENST00000256413 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTIF-201ENST00000256413 ANP32CO43423 234 aa22.5■■□□□ 1.19
CTIF-201ENST00000256413 FKBP8Q14318 412 aa22.39■■□□□ 1.17
CTIF-201ENST00000256413 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.32■■□□□ 1.16
CTIF-201ENST00000256413 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CTIF-201ENST00000256413 NBR1Q14596 966 aa22.23■■□□□ 1.15
CTIF-201ENST00000256413 BCL11AQ9H165 835 aa22.14■■□□□ 1.14
CTIF-201ENST00000256413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.11■■□□□ 1.13
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTIF-201ENST00000256413 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTIF-201ENST00000256413 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CTIF-201ENST00000256413 MIER1Q8N108 512 aa21.94■■□□□ 1.1
CTIF-201ENST00000256413 TRIM52Q96A61 297 aa21.94■■□□□ 1.1
CTIF-201ENST00000256413 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.15e-6■■■□□ 15.8
CTIF-201ENST00000256413 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTIF-201ENST00000256413 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CTIF-201ENST00000256413 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.83■■□□□ 1.09
CTIF-201ENST00000256413 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTIF-201ENST00000256413 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTIF-201ENST00000256413 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CTIF-201ENST00000256413 ARXQ96QS3 562 aa21.74■■□□□ 1.07
CTIF-201ENST00000256413 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CTIF-201ENST00000256413 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTIF-201ENST00000256413 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
CTIF-201ENST00000256413 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.68■■□□□ 1.06
CTIF-201ENST00000256413 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.65■■□□□ 1.06
CTIF-201ENST00000256413 NEFMP07197 916 aa21.65■■□□□ 1.06
CTIF-201ENST00000256413 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.61■■□□□ 1.05
CTIF-201ENST00000256413 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CTIF-201ENST00000256413 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 TONSLQ96HA7 1378 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 ABCC9O60706 1549 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-201ENST00000256413 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTIF-201ENST00000256413 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.49■■□□□ 1.03
CTIF-201ENST00000256413 MRS2Q9HD23 443 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-201ENST00000256413 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.43■■□□□ 1.02
CTIF-201ENST00000256413 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CTIF-201ENST00000256413 BECN1Q14457 450 aa21.42■■□□□ 1.02
CTIF-201ENST00000256413 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CTIF-201ENST00000256413 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTIF-201ENST00000256413 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTIF-201ENST00000256413 TMC1Q8TDI8 760 aa21.38■■□□□ 1.01
CTIF-201ENST00000256413 FBLN2P98095 1184 aa21.37■■□□□ 1.01
CTIF-201ENST00000256413 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.34■■□□□ 1.01
CTIF-201ENST00000256413 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CTIF-201ENST00000256413 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1
CTIF-201ENST00000256413 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.3■■□□□ 1
CTIF-201ENST00000256413 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
CTIF-201ENST00000256413 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.25■□□□□ 0.99
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CTIF-201ENST00000256413 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 240.5 ms