Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 NPLOC4-219ENST00000576713 571 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-8■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 NPLOC4-210ENST00000572824 559 ntTSL 411.06□□□□□ -0.643e-8■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 NPLOC4-211ENST00000573212 564 ntTSL 49.7□□□□□ -0.863e-8■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 LRPPRC-207ENST00000467058 557 ntTSL 36.92□□□□□ -1.35e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 GSE1-215ENST00000635906 666 ntTSL 314.75□□□□□ -0.052e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.46e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.046e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.646e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 ATP2C1-213ENST00000508297 540 ntTSL 44.83□□□□□ -1.642e-6■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 216.6■□□□□ 0.253e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.316e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 KDM5B-201ENST00000235790 4418 ntTSL 216.71■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 SEC31A-206ENST00000436790 1717 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.636e-8■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 DGCR8-204ENST00000457069 770 ntTSL 320.6■□□□□ 0.897e-10■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 STAT5A-206ENST00000479417 553 ntTSL 314.49□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 KIF13A-211ENST00000507576 529 ntTSL 326.8■■□□□ 1.887e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 HDAC3-210ENST00000490808 605 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 HDAC3-214ENST00000495485 797 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 12.8
DDX24Q9GZR7 NPEPPS-208ENST00000527298 1569 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.212e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NPEPPS-225ENST00000602788 4698 ntTSL 58.16□□□□□ -1.12e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NPEPPS-204ENST00000525037 1406 ntTSL 55.42□□□□□ -1.542e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.112e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.872e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ANLN-205ENST00000428612 707 ntTSL 56.05□□□□□ -1.443e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 YARS-205ENST00000472692 773 ntTSL 58.6□□□□□ -1.033e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 GDI1-208ENST00000471972 534 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NCBP3-207ENST00000577169 645 ntTSL 1 (best)19.01■□□□□ 0.633e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NCBP3-205ENST00000575815 4096 ntTSL 210.06□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 AFF1-206ENST00000507468 1486 ntTSL 1 (best)25.4■■□□□ 1.665e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 220.28■□□□□ 0.845e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 AFF1-205ENST00000504956 1668 ntTSL 219.18■□□□□ 0.665e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 AFF1-207ENST00000511442 463 ntTSL 32.6□□□□□ -1.995e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)27.38■■□□□ 1.972e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SSBP3-201ENST00000326956 2913 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SSBP3-207ENST00000426150 851 ntTSL 37.08□□□□□ -1.282e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SLC3A2-222ENST00000546253 582 ntTSL 417.92■□□□□ 0.464e-13■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 FAM160B2-207ENST00000477614 587 ntTSL 321.41■■□□□ 1.021e-9■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 VPS13D-210ENST00000489961 443 ntTSL 513.19□□□□□ -0.32e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ENO2-206ENST00000536199 823 ntTSL 516.21■□□□□ 0.199e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SPG7-210ENST00000564409 717 ntTSL 318.17■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 AC026464.4-201ENST00000570054 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 GMPPA-209ENST00000480034 571 ntTSL 224.46■■□□□ 1.511e-9■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 GMPPA-212ENST00000496536 302 ntTSL 512.39□□□□□ -0.431e-9■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 321.93■■□□□ 1.13e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 221.93■■□□□ 1.13e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCDC12-212ENST00000605358 402 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.733e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-10■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.531e-7■■□□□ 12.7
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DDX24Q9GZR7 CHD1L-207ENST00000485113 377 ntTSL 36.64□□□□□ -1.357e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 RPS6KC1-204ENST00000490299 5154 ntTSL 1 (best)4.37□□□□□ -1.717e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NRDC-207ENST00000475310 1025 ntTSL 26.48□□□□□ -1.371e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCAR1-202ENST00000398676 565 ntTSL 38.75□□□□□ -1.017e-9■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 56.65□□□□□ -1.347e-9■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 UHRF2-205ENST00000468435 3723 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.455e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.375e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 HMGCR-206ENST00000508070 450 ntTSL 39.45□□□□□ -0.95e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 UHRF2-211ENST00000484159 3112 ntTSL 24.94□□□□□ -1.625e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 UHRF2-212ENST00000485617 3460 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.665e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 POLR2B-212ENST00000510355 581 ntTSL 38.58□□□□□ -1.044e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SNAPC3-204ENST00000461041 403 ntTSL 224.3■■□□□ 1.484e-8■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 FNBP4-205ENST00000526109 673 ntTSL 34.52□□□□□ -1.691e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 MOV10-214ENST00000490413 1370 ntTSL 217.73■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NOP53-203ENST00000594525 876 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.246e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.252e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 YARS-207ENST00000481895 1018 ntTSL 524.31■■□□□ 1.482e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SRRT-203ENST00000445337 446 ntTSL 37.56□□□□□ -1.29e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.085e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 RBM25-202ENST00000525161 541 ntTSL 414.11□□□□□ -0.153e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.291e-26■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 HDAC3-209ENST00000486618 711 ntTSL 37.94□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 HGS-215ENST00000576393 922 ntTSL 225.17■■□□□ 1.621e-6■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SART3-206ENST00000546815 2318 ntTSL 513.93□□□□□ -0.188e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.38e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.568e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.868e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SF3A3-203ENST00000461869 776 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SF3A3-208ENST00000489537 891 ntTSL 47.63□□□□□ -1.192e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 GPI-213ENST00000590362 378 ntTSL 513.35□□□□□ -0.272e-17■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.52e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 WDR76-203ENST00000452115 813 ntTSL 520.08■□□□□ 0.816e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SUN1-226ENST00000467483 992 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SUN1-234ENST00000493681 526 ntTSL 315.14■□□□□ 0.012e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SUN1-214ENST00000435699 676 ntTSL 314.54□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 SUN1-230ENST00000477950 575 ntTSL 313.17□□□□□ -0.32e-7■■□□□ 12.7
DDX24Q9GZR7 PSMD2-216ENST00000488085 543 ntTSL 410.65□□□□□ -0.77e-14■■□□□ 12.7
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