RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485617.6

UHRF2-212, Transcript of ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UHRF2, Length 3,460 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2-212ENST00000485617 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.95□□□□□ -0.98
UHRF2-212ENST00000485617 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.83□□□□□ -1.16
UHRF2-212ENST00000485617 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
UHRF2-212ENST00000485617 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.56□□□□□ -1.2
UHRF2-212ENST00000485617 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.38□□□□□ -1.23
UHRF2-212ENST00000485617 ABCC9O60706 1549 aa7.23□□□□□ -1.25
UHRF2-212ENST00000485617 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UHRF2-212ENST00000485617 NACADO15069 1562 aa7.1□□□□□ -1.27
UHRF2-212ENST00000485617 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.08□□□□□ -1.28
UHRF2-212ENST00000485617 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
UHRF2-212ENST00000485617 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.02□□□□□ -1.29
UHRF2-212ENST00000485617 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
UHRF2-212ENST00000485617 SCRIBQ14160 1630 aa6.98□□□□□ -1.29
UHRF2-212ENST00000485617 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.98□□□□□ -1.29
UHRF2-212ENST00000485617 CHIC1Q5VXU3 224 aa6.97□□□□□ -1.29
UHRF2-212ENST00000485617 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
UHRF2-212ENST00000485617 POTEDQ86YR6 584 aa6.95□□□□□ -1.3
UHRF2-212ENST00000485617 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.89□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.88□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 WIZO95785 1651 aa6.86□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 SMARCA4P51532 1647 aa6.85□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.84□□□□□ -1.31
UHRF2-212ENST00000485617 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.83□□□□□ -1.32
UHRF2-212ENST00000485617 SMARCA2P51531 1590 aa6.79□□□□□ -1.32
UHRF2-212ENST00000485617 HRCP23327 699 aa6.74□□□□□ -1.33
UHRF2-212ENST00000485617 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.69□□□□□ -1.34
UHRF2-212ENST00000485617 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
UHRF2-212ENST00000485617 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.65□□□□□ -1.34
UHRF2-212ENST00000485617 PRDM2Q13029 1718 aa6.65□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.64□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 KIF21BO75037 1637 aa6.64□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 EEA1Q15075 1411 aa6.62□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 HMGXB3Q12766 1538 aa6.61□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 ABCC8Q09428 1581 aa6.6□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.59□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 SYNJ1O43426 1573 aa6.59□□□□□ -1.35
UHRF2-212ENST00000485617 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
UHRF2-212ENST00000485617 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.58□□□□□ -1.36
UHRF2-212ENST00000485617 TOP2BQ02880 1626 aa6.58□□□□□ -1.36
UHRF2-212ENST00000485617 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
UHRF2-212ENST00000485617 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.54□□□□□ -1.36
UHRF2-212ENST00000485617 TRIM41Q8WV44 630 aa6.52□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.52□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 NCAPD3P42695 1498 aa6.52□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.51□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 SOGA1O94964 1423 aa6.49□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 GOLGA3Q08378 1498 aa6.49□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.48□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 CEP162Q5TB80 1403 aa6.48□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.47□□□□□ -1.37
UHRF2-212ENST00000485617 PRXQ9BXM0 1461 aa6.46□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 CFTRP13569 1480 aa6.45□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 CUX1P39880 1505 aa6.44□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 WDR97A6NE52 1622 aa6.42□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 CUX2O14529 1486 aa6.41□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 MAP3K1Q13233 1512 aa6.4□□□□□ -1.38
UHRF2-212ENST00000485617 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.39□□□□□ -1.39
UHRF2-212ENST00000485617 ARAP1Q96P48 1450 aa6.38□□□□□ -1.39
UHRF2-212ENST00000485617 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.38□□□□□ -1.39
UHRF2-212ENST00000485617 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.37□□□□□ -1.39
UHRF2-212ENST00000485617 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.36□□□□□ -1.39
UHRF2-212ENST00000485617 CLIP1P30622 1438 aa6.36□□□□□ -1.39
UHRF2-212ENST00000485617 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.33□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 CUL7Q14999 1698 aa6.31□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.31□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.31□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.3□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.3□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.29□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.29□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 TIAM1Q13009 1591 aa6.28□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 SAMD9Q5K651 1589 aa6.28□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.28□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
UHRF2-212ENST00000485617 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 39.1
UHRF2-212ENST00000485617 KIF27Q86VH2 1401 aa6.27□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.27□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.26□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.25□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.25□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 IGF1RP08069 1367 aa6.24□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.24□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 ARHGEF11O15085 1522 aa6.23□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 TOPBP1Q92547 1522 aa6.21□□□□□ -1.41
UHRF2-212ENST00000485617 MAPKBP1O60336 1514 aa6.21□□□□□ -1.42
UHRF2-212ENST00000485617 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.21□□□□□ -1.42
UHRF2-212ENST00000485617 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.21□□□□□ -1.42
UHRF2-212ENST00000485617 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
UHRF2-212ENST00000485617 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms