Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PJA1Q8NG27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PJA1Q8NG27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PJA1Q8NG27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms