Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NFIXQ14938 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NFIXQ14938 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NFIXQ14938 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
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