Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
NFIXQ14938 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NFIXQ14938 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NFIXQ14938 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NFIXQ14938 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NFIXQ14938 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
NFIXQ14938 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
NFIXQ14938 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
NFIXQ14938 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NFIXQ14938 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NFIXQ14938 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NFIXQ14938 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
NFIXQ14938 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NFIXQ14938 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NFIXQ14938 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NFIXQ14938 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
NFIXQ14938 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NFIXQ14938 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NFIXQ14938 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NFIXQ14938 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NFIXQ14938 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
NFIXQ14938 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NFIXQ14938 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NFIXQ14938 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NFIXQ14938 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NFIXQ14938 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NFIXQ14938 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NFIXQ14938 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NFIXQ14938 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NFIXQ14938 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NFIXQ14938 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
NFIXQ14938 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NFIXQ14938 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
NFIXQ14938 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
NFIXQ14938 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
NFIXQ14938 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
NFIXQ14938 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NFIXQ14938 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NFIXQ14938 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NFIXQ14938 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NFIXQ14938 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NFIXQ14938 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NFIXQ14938 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NFIXQ14938 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NFIXQ14938 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NFIXQ14938 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
NFIXQ14938 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NFIXQ14938 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NFIXQ14938 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NFIXQ14938 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NFIXQ14938 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NFIXQ14938 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NFIXQ14938 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NFIXQ14938 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NFIXQ14938 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NFIXQ14938 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NFIXQ14938 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NFIXQ14938 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NFIXQ14938 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NFIXQ14938 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NFIXQ14938 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NFIXQ14938 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NFIXQ14938 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NFIXQ14938 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NFIXQ14938 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NFIXQ14938 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
NFIXQ14938 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NFIXQ14938 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NFIXQ14938 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NFIXQ14938 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NFIXQ14938 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NFIXQ14938 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NFIXQ14938 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NFIXQ14938 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NFIXQ14938 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NFIXQ14938 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NFIXQ14938 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
NFIXQ14938 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NFIXQ14938 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NFIXQ14938 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NFIXQ14938 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NFIXQ14938 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NFIXQ14938 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NFIXQ14938 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NFIXQ14938 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NFIXQ14938 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NFIXQ14938 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NFIXQ14938 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NFIXQ14938 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NFIXQ14938 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NFIXQ14938 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NFIXQ14938 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NFIXQ14938 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NFIXQ14938 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NFIXQ14938 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NFIXQ14938 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NFIXQ14938 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NFIXQ14938 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NFIXQ14938 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NFIXQ14938 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
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