Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA3CQ13748 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBA3CQ13748 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA3CQ13748 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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