Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TUBA3CQ13748 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TUBA3CQ13748 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TUBA3CQ13748 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBA3CQ13748 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TUBA3CQ13748 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TUBA3CQ13748 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TUBA3CQ13748 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TUBA3CQ13748 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
TUBA3CQ13748 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBA3CQ13748 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TUBA3CQ13748 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TUBA3CQ13748 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TUBA3CQ13748 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TUBA3CQ13748 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TUBA3CQ13748 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TUBA3CQ13748 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TUBA3CQ13748 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TUBA3CQ13748 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TUBA3CQ13748 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBA3CQ13748 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TUBA3CQ13748 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBA3CQ13748 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBA3CQ13748 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBA3CQ13748 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBA3CQ13748 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBA3CQ13748 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TUBA3CQ13748 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBA3CQ13748 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBA3CQ13748 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TUBA3CQ13748 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBA3CQ13748 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBA3CQ13748 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBA3CQ13748 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBA3CQ13748 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBA3CQ13748 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBA3CQ13748 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBA3CQ13748 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUBA3CQ13748 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBA3CQ13748 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUBA3CQ13748 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBA3CQ13748 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBA3CQ13748 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBA3CQ13748 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBA3CQ13748 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBA3CQ13748 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUBA3CQ13748 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TUBA3CQ13748 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBA3CQ13748 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBA3CQ13748 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBA3CQ13748 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBA3CQ13748 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBA3CQ13748 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBA3CQ13748 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBA3CQ13748 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBA3CQ13748 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBA3CQ13748 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBA3CQ13748 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBA3CQ13748 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBA3CQ13748 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBA3CQ13748 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBA3CQ13748 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUBA3CQ13748 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBA3CQ13748 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBA3CQ13748 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBA3CQ13748 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBA3CQ13748 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBA3CQ13748 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBA3CQ13748 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBA3CQ13748 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBA3CQ13748 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBA3CQ13748 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBA3CQ13748 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBA3CQ13748 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBA3CQ13748 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBA3CQ13748 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBA3CQ13748 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBA3CQ13748 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBA3CQ13748 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBA3CQ13748 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBA3CQ13748 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBA3CQ13748 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBA3CQ13748 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBA3CQ13748 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBA3CQ13748 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBA3CQ13748 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBA3CQ13748 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBA3CQ13748 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBA3CQ13748 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBA3CQ13748 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBA3CQ13748 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBA3CQ13748 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBA3CQ13748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBA3CQ13748 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBA3CQ13748 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBA3CQ13748 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBA3CQ13748 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBA3CQ13748 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBA3CQ13748 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBA3CQ13748 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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