Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDK4P11802 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDK4P11802 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK4P11802 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK4P11802 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK4P11802 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK4P11802 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK4P11802 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK4P11802 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK4P11802 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK4P11802 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDK4P11802 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK4P11802 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK4P11802 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK4P11802 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK4P11802 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK4P11802 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK4P11802 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK4P11802 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK4P11802 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK4P11802 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms