Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK4P11802 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK4P11802 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CDK4P11802 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDK4P11802 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK4P11802 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK4P11802 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK4P11802 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDK4P11802 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CDK4P11802 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDK4P11802 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CDK4P11802 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK4P11802 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CDK4P11802 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK4P11802 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CDK4P11802 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK4P11802 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDK4P11802 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDK4P11802 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CDK4P11802 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CDK4P11802 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CDK4P11802 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDK4P11802 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK4P11802 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK4P11802 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK4P11802 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CDK4P11802 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CDK4P11802 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CDK4P11802 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDK4P11802 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CDK4P11802 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CDK4P11802 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CDK4P11802 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CDK4P11802 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CDK4P11802 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CDK4P11802 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK4P11802 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CDK4P11802 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CDK4P11802 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDK4P11802 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK4P11802 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK4P11802 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK4P11802 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK4P11802 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK4P11802 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK4P11802 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK4P11802 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK4P11802 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK4P11802 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK4P11802 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK4P11802 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK4P11802 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDK4P11802 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDK4P11802 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK4P11802 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDK4P11802 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK4P11802 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CDK4P11802 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDK4P11802 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CDK4P11802 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDK4P11802 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CDK4P11802 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK4P11802 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CDK4P11802 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CDK4P11802 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK4P11802 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK4P11802 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDK4P11802 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDK4P11802 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK4P11802 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CDK4P11802 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CDK4P11802 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDK4P11802 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CDK4P11802 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CDK4P11802 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CDK4P11802 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDK4P11802 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDK4P11802 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDK4P11802 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDK4P11802 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK4P11802 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDK4P11802 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK4P11802 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK4P11802 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK4P11802 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK4P11802 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK4P11802 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CDK4P11802 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK4P11802 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CDK4P11802 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDK4P11802 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDK4P11802 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDK4P11802 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK4P11802 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK4P11802 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDK4P11802 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDK4P11802 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK4P11802 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK4P11802 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK4P11802 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms